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The DNA sequence and biology of human chromosome 19

机译:人类19号染色体的DNA序列和生物学

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摘要

Chromosome 19 has the highest gene density of all human chromosomes, more than double the genome-wide average. The large clustered gene families, corresponding high G+C content, CpG islands and density of repetitive DNA indicate a chromosome rich in biological and evolutionary significance. Here we describe 55.8 million base pairs of highly accurate finished sequence representing 99.9% of the euchromatin portion of the chromosome. Manual curation of gene loci reveals 1,461 protein-coding genes and 321 pseudogenes. Among these are genes directly implicated in mendelian disorders, including familial hypercho-lesterolaemia and insulin-resistant diabetes. Nearly one-quarter of these genes belong to tandemly arranged families, encompassing more than 25% of the chromosome. Comparative analyses show a fascinating picture of conservation and divergence, revealing large blocks of gene orthology with rodents, scattered regions with more recent gene family expansions and deletions, and segments of coding and non-coding conservation with the distant fish species Takifugu.
机译:19号染色体在所有人类染色体中具有最高的基因密度,是全基因组平均水平的两倍以上。大型簇状基因家族,相应的高G + C含量,CpG岛和重复DNA密度表明,一条染色体具有丰富的生物学和进化意义。在这里,我们描述了高度完成的序列的5580万个碱基对,它们代表染色体的常染色质部分的99.9%。手动管理基因位点可发现1,461个蛋白质编码基因和321个假基因。其中有直接与孟德尔疾病有关的基因,包括家族性高胆固醇血症和胰岛素抵抗性糖尿病。这些基因中近四分之一属于串联排列的家族,涵盖了25%以上的染色体。比较分析显示出令人着迷的保护和分歧图景,揭示了带有啮齿动物的大块基因正交学,具有较新的基因家族扩展和缺失的分散区域,以及远处的鱼类塔基富格的编码和非编码保护片段。

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