...
  • 主题
高级搜索  >
历史搜索 清空历史
首页> 外文期刊>The American Journal of Tropical Medicine and Hygiene >Estimation of copy number using SYBR Green: confounding by AT-rich DNA and by variation in amplicon length.
【24h】

Estimation of copy number using SYBR Green: confounding by AT-rich DNA and by variation in amplicon length.

机译：使用SYBR Green估算拷贝数：被富含AT的DNA和扩增子长度的变化所混淆。

获取原文
获取原文并翻译 | 示例
           
页面导航
  • 摘要
  • 著录项
  • 相似文献
  • 相关主题

摘要

Although SYBR Green is used to estimate copy number, its fluorescence varies with amplicon length and adenine/thymine (AT) content. As a result, threshold cycle (Ct) values obtained using real-time polymerase chain reaction (PCR) are lower for longer amplicons (P<0.001) and amplicons with greater AT content (P<0.001). In contrast, neither amplicon length nor AT content affects the Ct with TaqMan probes or LUX-labeled primers. Because SYBR Green yields lower Cts with AT-rich templates and longer templates, it overestimates copy number for those templates. Therefore, sequence-specific methods such as TaqMan probes or LUX-labeled primers should be considered when using real-time PCR to estimate copy number if the amplicons generated are AT-rich or vary in length.
机译：尽管SYBR Green用于估算拷贝数，但其荧光随扩增子长度和腺嘌呤/胸腺嘧啶（AT）含量而变化。结果，对于更长的扩增子（P <0.001）和具有更高AT含量的扩增子（P <0.001），使用实时聚合酶链反应（PCR）获得的阈值循环（Ct）值较低。相反，使用TaqMan探针或LUX标记的引物，扩增子的长度和AT含量均不会影响Ct。由于SYBR Green使用富含AT的模板产生的Cts较低，而模板更长，因此高估了这些模板的拷贝数。因此，如果生成的扩增子富含AT或长度变化，则在使用实时PCR估计拷贝数时，应考虑使用TaqMan探针或LUX标记的引物等序列特异性方法。

著录项

相似文献

  • 外文文献
  • 中文文献
  • 专利
获取原文

客服邮箱：kefu@zhangqiaokeyan.com

京公网安备：11010802029741号 ICP备案号：京ICP备15016152号-6 六维联合信息科技 (北京) 有限公司©版权所有

  • 客服微信

  • 服务号