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Peak alignment using restricted edit distances

机译:使用受限的编辑距离进行峰对齐

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摘要

A peak is a pair of real values (x, y), where x is the time when peak of height y is registered. In the peak alignment problem, we are given two sequences of peaks, and our task is to align the sequences allowing some basic edit operations on the peaks. We study an instance of the peak alignment problem that arises in the analysis of Mass Spectrometry data in Systems Biology. There the measurement technique guarantees that two peaks (x, y), (x', y') can only be considered the same if x is close enough toe, and y is close enough to y'. We review some methods to do alignment under such restrictions on matches. (C) 2007 Elsevier B.V. All rights reserved.
机译:峰值是一对实数值(x,y),其中x是记录高度y峰值的时间。在峰对齐问题中,我们给了两个峰序列,我们的任务是对齐序列以允许对峰进行一些基本的编辑操作。我们研究了系统生物学中质谱数据分析中出现的峰对齐问题的实例。那里的测量技术确保只有在x的脚趾足够近且y的距离y'足够近的情况下,才能将两个峰(x,y),(x',y')视为相同。我们回顾了在这种匹配限制下进行对齐的一些方法。 (C)2007 Elsevier B.V.保留所有权利。

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