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The evolution simulation of zinc finger domain sequence—Application of genetic algorithms in protein structure study

机译:锌指结构域序列的进化模拟—遗传算法在蛋白质结构研究中的应用

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摘要

GENETIC algorithms are very efficient search mechanisms. The application of genetic algorithms in the protein structure study provides not only a convenience algorithm for the search of the lowest energy status (according to the thermodynamics theory,the natural protein has the lowest energy status), but a new kind of research method. Some potential zinc finger primary structure is evoluted from animo acid sequences generated randomly. The work in this note not only gives some evidence for the random origin of amino acid sequence, but investigates the ability of genetic algorithms to search vast conformational spaces.
机译:GENETIC算法是非常有效的搜索机制。遗传算法在蛋白质结构研究中的应用不仅为寻找最低能量状态(根据热力学理论,天然蛋白质具有最低能量状态)提供了一种方便的算法,而且提供了一种新的研究方法。一些潜在的锌指一级结构是从随机产生的苯胺酸序列进化而来的。本文中的工作不仅为氨基酸序列的随机起源提供了一些证据,而且还研究了遗传算法搜索巨大构象空间的能力。

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