Graph spectra as a systematic tool in computational biology

Banerjee A; Jost J

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Graph spectra as a systematic tool in computational biology

机译：图谱作为计算生物学中的系统工具

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We present the spectrum of the (normalized) graph Laplacian as a systematic tool for the investigation of networks, and we describe basic properties of eigenvalues and eigenfunctions. Processes of graph formation like motif joining or duplication leave characteristic traces in the spectrum. This can suggest hypotheses about the evolution of a graph representing biological data.

机译：我们介绍（规范化的）图拉普拉斯算子的频谱，作为研究网络的系统工具，并描述特征值和特征函数的基本属性。图的形成过程（例如主题连接或复制）会在光谱中留下特征痕迹。这可以提出有关代表生物学数据的图的演变的假设。

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来源
《Discrete Applied Mathematics》 |2009年第10期|共7页
作者
Banerjee A; Jost J;
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作者单位

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收录信息
原文格式 PDF
正文语种 eng
中图分类离散数学;
关键词
Biological network; Graph spectrum; Spectral plot; Graph evolution; Metabolic network; Transcription network; Protein-protein interaction network; Neuronal network; Foodweb;

机译：生物网络;图谱;光谱图;图演化;代谢网络;转录网络;蛋白质-蛋白质相互作用网络;神经网络;食物网;

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