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首页> 外文期刊>Journal of Bioinformatics and Computational Biology >Analysis of qPCR data by converting exponentially related Ct values into linearly related X_0 values
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Analysis of qPCR data by converting exponentially related Ct values into linearly related X_0 values

机译：通过将指数相关的Ct值转换为线性相关的X_0值来分析qPCR数据

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A common method for calculating results from qPCR experiments is the comparative Ct method, also called the 2~(-ΔΔCt) method. However, several assumptions are included in the 2~(-ΔΔCt) method and standard statistical analyses are not directly applicable. Here, we describe a different method, the X_0 method, for result calculations and statistical analysis from qPCR experiments. The X_0 method differs from the 2~(-ΔΔCt) method by introducing a conversion of the exponentially related Ct values into linearly related X_0 values, which represent the amount of starting material in a qPCR experiment. Results calculated by the X_0 method are illustrated for qPCR experiments with technical and biological replicates, including procedures to calculate standard deviations. Incorporation of primer efficiencies in calculations by the X _0 method is also described. Altogether, the X_0 method constitutes a very simple and accurate alternative to the 2 ~(-ΔΔCt) method for result calculations from qPCR data.
机译：qPCR实验计算结果的常用方法是比较Ct方法，也称为2〜（-ΔΔCt）方法。但是，2-（-ΔΔCt）方法中包含一些假设，标准统计分析不能直接应用。在这里，我们描述了一种不同的方法X_0方法，用于qPCR实验的结果计算和统计分析。 X_0方法与2〜（-ΔΔCt）方法的不同之处在于，将指数相关的Ct值转换为线性相关的X_0值，这些值表示qPCR实验中的起始物料量。通过X_0方法计算得出的结果可用于qPCR实验，该实验具有技术和生物学上的重复性，包括计算标准差的程序。还介绍了通过X _0方法在计算中引入引物效率的方法。总而言之，X_0方法构成了从qPCR数据进行结果计算的2〜（-ΔΔCt）方法的一种非常简单而准确的替代方法。

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