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【24h】

Real-time RT-PCR法によるァストロウィルス遺伝子の検出

机译:实时RT-PCR方法检测星状病毒基因

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摘要

ァストロウィルス(Human astrovirus : HAstV)を検出するためのReal-time reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR)法を開発した. HAstVゲノムのOpen reading frame 2 (0RF2)のうち,比較的保存性の高い5'末端領域をReal-time RT-PCR 法の 標的 配列と して 選択し, プライマーおよびTaqMan MGBプローブを新たに設計した.HAstV1 型から7型の各血清型(コントロールプラスミド)ともに30copies/tubeから3.0 x107copies/tubeの範囲で遺伝子の定量が可能であり,検出感度は各血清型ともに30copies/tubeであつた.また,HAstV陽性の臨床検体から抽出した遺伝子についても検出が可能であった.Real-time RT-PCR法はConventional RT-PCR法に比べ,10からlO倍感度が高く, ノロウィルス,サボウィルス,A群ロタウィルス,及びアデノウイルスとの交差反応は全く認められなかった.以上の結果から,今回開発したReal-time RT-PCR法は,従来のConevntional RT-PCR法と比較して,簡便で迅速にHAstVl型から7型までの各血清型の遺伝子を検出し,定量することが可能であると考えられた.
机译:我们已经开发了一种实时逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)方法来检测人类星状病毒(HAstV),在HAst​​V基因组的开放阅读框2(0RF2)中相对保守。选择高5'端区域作为Real-time RT-PCR方法的靶序列,并重新设计了引物和TaqMan MGB探针,每种HAstV1至7型血清类型(对照质粒)每份30拷贝。定量基因的范围为每管3.0 x 107拷贝/管,每种血清类型的检测灵敏度为30拷贝/管,还可以检测从HAstV阳性临床标本中提取的基因。实时RT-PCR方法的灵敏度是常规RT-PCR方法的10到10倍,并且未观察到与诺如病毒,嗜血杆菌病毒,A组轮状病毒和腺病毒的交叉反应。基于以上结果,本次开发的实时RT-PCR方法比常规的常规RT-PCR方法更容易,更快速地检测和定量从HAstV1型到7型的每种血清型的基因。人们认为可以这样做。

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