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首页> 外文期刊>Acta crystallographica. Section C, Structural chemistry. >Eight new crystal structures of 5-(hydroxy-methyl)uracil, 5-carboxyuracil and 5-carboxy-2-thiouracil: insights into the hydrogen-bonded networks and the predominant conformations of the C5-bound residues
【24h】

Eight new crystal structures of 5-(hydroxy-methyl)uracil, 5-carboxyuracil and 5-carboxy-2-thiouracil: insights into the hydrogen-bonded networks and the predominant conformations of the C5-bound residues

机译：5-（羟甲基）尿嘧啶，5-羧脲和5-羧基-2-硫嘧啶的八种新晶体结构：洞察氢键网络和C5结合残留的主要构象

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In order to examine the preferred hydrogen-bonding pattern of various uracil derivatives, namely 5-(hydroxymethyl)uracil, 5-carboxyuracil and 5-carboxy-2-thiouracil, and for a conformational study, crystallization experiments yielded eight different structures: 5-(hydroxymethyl)uracil, C5H6N2O3, (I), 5-carboxy-uracil-N,N-dimethylformamide (1/1), CsH4N2O4-C3H7NO, (II), 5-carboxyura-cil-dimethyl sulfoxide (1/1), CsH^CVCzHgOS, (III), 5-carboxyuracil-N,N-dimethylacetamide (1/1), CSH4N2O4-C4H9NO, (IV), 5-carboxy-2-thiouracil-N,N-dimethylformamide (1/1), CsH4N2O3S-C3H7NO, (V), 5-carboxy-2-thioura-cil-dimethyl sulfoxide (1/1), CsH^OsSCzHgOS, (VI), 5-carboxy-2-thiouracil-1,4-dioxane (2/3), 2CsH4N2O3S-3C6H12O3, (VII), and 5-carboxy-2-thiouracil, C10H8N4O6S2, (VIII). While the six solvated structures, i.e. (II)-(VII), contain intramolecular S(6) O—H ? -O hydrogen-bond motifs between the carboxy and carbonyl groups, the usually favoured R22(8) pattern between two carboxy groups is formed in the solvent-free structure, i.e. (VIII). Further R22(8) hydrogen-bond motifs involving either two N—H ? -O or two N—H ? -S hydrogen bonds were observed in three crystal structures, namely (I), (IV) and (VIII). In all eight structures, the residue at the ring 5-position shows a coplanar arrangement with respect to the pyrimidine ring which is in agreement with a search of the Cambridge Structural Database for six-membered cyclic compounds containing a carboxy group. The search confirmed that coplanarity between the carboxy group and the cyclic residue is strongly favoured.
机译：为了检查各种尿嘧啶衍生物的优选的氢键合图案，即5-（羟甲基）尿嘧啶，5-羧脲尿嘧啶和5-羧基-2-硫嘧啶，以及一致性研究，结晶实验产生了八种不同的结构：5- （羟甲基）Uracil，C5H6N2O3，（I），5-羧基 - 尿嘧啶-N，N-二甲基甲酰胺（1/1），CSH4N2O4-C3H7 NO，（II），5-羧脲-CIL-二甲基磺砜（1/1）， CSH ^ CVCZHGOS，（III），5-羧脲脲-N，N-二甲基乙酰胺（1/1），CSH4N2O4-C4H9NO，（IV），5-羧基-2-硫嘧啶-N，N-二甲基甲酰胺（1/1）， CSH4N2O3S-C3H7 NO，（V），5-羧基-2-硫脲-CIL-二甲基亚砜（1/1），CSH ^ OSSCZHGOS，（VI），5-羧基-2-硫嘧啶-1,4-二恶烷（2 / 3），2CH4N2O3S-3C6 -12O3，（VII）和5-羧基-2-硫嘧啶，C10H8N4O6S2，（VIII）。虽然六种溶剂化结构，即（ii） - （vii），含有分子内S（6）O-H？ - 羧基和羰基之间的氢键基序，在无溶剂结构中形成两个羧基之间的通常有利的R22（8）图案，即（VIII）。另外R22（8）涉及两种N-H的氢键基序？ -O或两个n-h？在三种晶体结构中观察到氢键，即（I），（IV）和（VIII）。在所有八个结构中，环5-位置的残留物显示相对于嘧啶环的共面条布置，这与携带羧基的六元环化合物的剑桥结构数据库进行搜索。搜索确认羧基与循环残余物之间的共面很强。

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