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首页> 外文期刊>Marine genomics >Complete genome of Pseudomonas sp. DMSP-1 isolated from the Arctic seawater of Kongsfjorden, Svalbard
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Complete genome of Pseudomonas sp. DMSP-1 isolated from the Arctic seawater of Kongsfjorden, Svalbard

机译：Pseudomonas sp的完整基因组。 DMSP-1与斯瓦尔巴德孔斯福滕北极海水隔离

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The genus Pseudomonas is highly metabolically diverse and has colonized a wide range of ecological niches. The strain Pseudomonas sp. DMSP-1 was isolated from Arctic seawater (Kongsfjorden, Svalbard) using di-methylsulfoniopropionate (DMSP) as the sole carbon source. To better understand its role in the Arctic coastal ecosystem, the genome of Pseudomonas sp. strain DMSP-1 was completely sequenced. The genome contained a circular chromosome of 6,282,445 bp with an average GC content of 60.01 mol%. A total of 5510 protein coding genes, 70 tRNA genes and 19 rRNA genes were obtained. However, no genes encoding known enzymes associated with DMSP catabolism were identified in the genome, suggesting that novel DMSP degradation genes might exist in Pseudomonas sp. strain DMSP-1.
机译：Pseudomonas属的高度代谢多样化，并殖民多种生态利基。 菌株假单胞菌SP。 DMSP-1使用二甲基磺基丙酸酯（DMSP）作为唯一碳源的北极海水（Kongsfjorden，Svalbard）分离。 为了更好地了解其在北极沿海生态系统中的作用，Pseudomonas sp的基因组。 菌株DMSP-1完全测序。 基因组含有6,282,445bp的圆形染色体，平均GC含量为60.01mol％。 得到总共5510个蛋白质编码基因，70个TRNA基因和19个RRNA基因。 然而，在基因组中没有没有编码与DMSP分解代谢相关的已知酶的基因，表明新型DMSP降解基因可能存在于假单胞菌SP中。 应变DMSP-1。

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