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De novo transcriptome assembly and functional annotation of the southern rock lobster (Jasus edwardsii)

机译：De Novo转录组合体组装和南部岩石龙虾的功能注释（Jasus Edwardsii）

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Southern rock lobsters (Jasus edwardsii) are a valuable commodity and comprise important fishery resources in Australia and New Zealand. Population genomic methods (e.g. reduced representation sequencing) have been used to investigate patterns of dispersal and recruitment and the role of local adaptation within rock lobster species. However, application of these methods is constrained by the lack of pre-existing reference genome or transcriptome for Jasus and/or closely related species. In this study, we build a reference transcriptome assembly of 187,981 transcripts for Jasus edwardsii based on RNA sequencing data of four tissues (eyestalk, green gland, hepatopancreas and supraesophageal ganglion). This work will provide a significant resource to aid in investigation of the molecular basis of biological and evolutionary processes relevant to the fishing industry of spiny lobster and related taxonomic groups.
机译：南方岩石龙虾（JASU Edwardsii）是一个有价值的商品，包括澳大利亚和新西兰的重要渔业资源。 人口基因组方法（例如，降低的表示测序）已被用于调查分散和招募的模式以及局部适应在岩石龙虾物种中的作用。 然而，这些方法的应用受到缺乏预先存在的纳豆和/或密切相关的物种的预先存在的参考基因组或转录组。 在这项研究中，基于四组织的RNA测序数据（眼睑，绿腺，肝病和肝病神经节），建立187,981份转录组件的参考转录组合组合组件。 这项工作将提供一项重要的资源，以帮助调查与多刺龙虾和相关分类群的渔业有关的生物和进化过程的分子基础。

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