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【24h】

Bar-HRM for identification of cryptic earthworm species

机译:条HRM用于识别神经蚯蚓种类

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摘要

Accurate species identification is crucial in ecological research on sentinel species such as earthworms. Here, we developed a reliable and cost-efficient method for the rapid identification of taxa within the Allolobophora chlorotica complex of cryptic earthworm species. We combined high resolution melting (HRM) analysis with DNA barcoding (Bar-HRM) in a three-step approach: (i) selection of a mini-barcode in the 16S mitochondrial gene, (ii) test of the method on a panel of 16 reference individuals and (iii) identification at the species level of 24 unknown specimens. Thus, we proved the efficacy of Bar-HRM to discriminate between cryptic sister (or sibling) earthworm species and we provided a standardized method that can be easily adapted to other taxa.
机译:准确的物种鉴定对于蚯蚓等哨兵种类的生态研究至关重要。 在这里,我们开发了一种可靠且具有成本效益的方法,可以快速鉴定神秘蚯蚓种类的血栓药物综合体内的分类群。 我们将高分辨率熔化(HRM)分析与DNA条形码(Bar-HRM)相结合:(i)在16S线粒体基因中选择迷你条形码,(ii)在面板上的方法测试 16参考个体和(iii)在24个未知标本的物种水平上识别。 因此,我们证明了Bar-Hrm歧视神秘姐妹(或兄弟)蚯蚓物种之间的疗效,我们提供了一种可以轻松适应其他分类群的标准化方法。

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