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首页> 外文期刊>Genomics >DA and Xiao-two giant and composite LTR-retrotransposon-like elements identified in the human genome.
【24h】

DA and Xiao-two giant and composite LTR-retrotransposon-like elements identified in the human genome.

机译：DA和Xiao在人类基因组中鉴定出两个巨大且复合的LTR-反转录转座子样元件。

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We discovered two new complex elements while studying large genomic rearrangements and segmental duplications in the human genome. Both resemble bacterial composite DNA transposon Tn9, consisting of a core flanked by mobile elements, except that the flanking element is not a DNA transposon but instead is long terminal repeat retrotransposon-like with human endogenous retrovirus and satellite sequences. Based on the core size, we named them Xiao ( approximately 30 kb) and DA ( approximately 280 kb), meaning small and big, respectively, in Chinese. Xiao originated from a 19p region encoding olfactory receptor 7E members after the human/ape divergence from Old World monkeys, while DA likely evolved from a Xiao by inserting approximately 200 kb of chimeric sequence from 16p and 21q into the Xiao core, resulting in a target site duplication of 3.4 kb. DA/Xiao was identified in 30 loci on 12 chromosomes, and only DAs mediated intrachromosomal rearrangements, based on our reconstructed human-mouse-rat ancestral genome and the rhesus macaque genome.
机译：在研究人类基因组中的大型基因组重排和节段重复时，我们发现了两个新的复杂元素。两者都类似于细菌复合DNA转座子Tn9，由一个以活动元件为侧翼的核心组成，除了该侧翼元件不是DNA转座子，而是人类内源性逆转录病毒和卫星序列的长末端重复逆转座子样。根据核心大小，我们将它们分别命名为Xiao（大约30 kb）和DA（大约280 kb），分别在中文中表示大小。在人类/猿类与旧大陆猴发生分歧之后，Xiao起源于一个编码嗅觉受体7E成员的19p区域，而DA可能是通过从Xiao进化而来的，方法是将16p和21q的约200 kb的嵌合序列插入Xiao核心，从而形成目标站点重复3.4 kb。根据我们重建的人鼠大鼠祖先基因组和恒河猴的基因组，在12个染色体上的30个基因座中鉴定出DA / Xiao，只有DAs介导了染色体内重排。

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