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Direct imaging of DNA motif sequences with encoded nanoparticles

机译:用编码的纳米颗粒对DNA基序序列进行直接成像

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摘要

We present a method for encoded tagging and imaging of short nucleic acid motif chains (oligomotifs) using selective hybridization of heterogeneous Au nanoparticles (Au-NP). The resulting encoded NP string is thus representative of the underlying motif sequence. As the NPs are much more massive than the motifs, the motif chain order can be directly observed using scanning electron microscopy. Using this technique we demonstrate direct sequencing of oligomotifs in single DNA molecules consisting of four 100-nt motif chains tagged with four different types of NPs. The method outlined is a precursor for a high density direct sequencing technology.
机译:我们提出了一种使用异质Au纳米粒子(Au-NP)的选择性杂交对短核酸基序链(olimotmotifs)进行编码标记和成像的方法。因此,所得的编码的NP串代表潜在的基序序列。由于NP比基序大得多,因此可以使用扫描电子显微镜直接观察基序链的顺序。使用这种技术,我们证明了在单个DNA分子中寡基的直接测序,该DNA分子由四个带有四种不同类型NP标记的100 nt基序链组成。概述的方法是高密度直接测序技术的前身。

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