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PLoS Computational Biology

【机译】：公共科学图书馆·计算生物学

ISSN：-
出版周期：Monthly
语言：English

起始发布年份：2005
出版者：San Francisco, CA : Public Library of Science, [2005]-
出版地：United States

NLM刊名缩写：PLoS Comput Biol

数据库引入：PubMed: v1n1, June 2005-, PMC

MeSH词表主题词：Computational Biology*

备注：Print issues ceased with v.4, no.1 (2008). Issues 1-7, 10, 12 (2006) and Issues展开▼

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1.Understanding narwhal diving behaviour using Hidden Markov Models with dependent state distributions and long range dependence

机译：使用具有相关状态分布和远距离相关性的隐马尔可夫模型了解独角鲸的潜水行为
- 作者：Manh Cuong Ngô;Mads Peter Heide-Jørgensen;Susanne Ditlevsen
- 期刊名称：《PLoS Computational Biology》 | 2019年第3期
2.A multiscale model of epigenetic heterogeneity-driven cell fate decision-making

机译：表观遗传异质性驱动的细胞命运决策的多尺度模型
- 作者：Núria Folguera-Blasco;Rubén Pérez-Carrasco;Elisabet Cuyàs;Javier A. Menendez;Tomás Alarcón
- 期刊名称：《PLoS Computational Biology》 | 2019年第4期
3.Soma-axon coupling configurations that enhance neuronal coincidence detection

机译：增强神经元重合检测的Soma-轴突耦合配置
- 作者：Joshua H. Goldwyn;Michiel W. H. Remme;John Rinzel
- 期刊名称：《PLoS Computational Biology》 | 2019年第3期
4.Locus Coeruleus tracking of prediction errors optimises cognitive flexibility: An Active Inference model

机译：预测错误的蓝斑轨迹跟踪可优化认知灵活性：主动推理模型
- 作者：Anna C. Sales;Karl J. Friston;Matthew W. Jones;Anthony E. Pickering;Rosalyn J. Moran
- 期刊名称：《PLoS Computational Biology》 | 2019年第1期
5.A Bayesian framework for the analysis of systems biology models of the brain

机译：用于分析大脑系统生物学模型的贝叶斯框架
- 作者：Joshua Russell-Buckland;Christopher P. Barnes;Ilias Tachtsidis
- 期刊名称：《PLoS Computational Biology》 | 2019年第4期
6.A computational framework to assess genome-wide distribution of polymorphic human endogenous retrovirus-K In human populations

机译：计算人群中多态性人类内源性逆转录病毒-K的全基因组分布的计算框架
- 作者：Weiling Li;Lin Lin;Raunaq Malhotra;Lei Yang;Raj Acharya;Mary Poss
- 期刊名称：《PLoS Computational Biology》 | 2019年第3期
7.Computational translation of genomic responses from experimental model systems to humans

机译：从实验模型系统到人类的基因组响应的计算翻译
- 作者：Douglas K. Brubaker;Elizabeth A. Proctor;Kevin M. Haigis;Douglas A. Lauffenburger
- 期刊名称：《PLoS Computational Biology》 | 2019年第1期
8.BEAST 2.5: An advanced software platform for Bayesian evolutionary analysis

机译：BEAST 2.5：用于贝叶斯进化分析的高级软件平台
- 作者：Remco Bouckaert;Timothy G. Vaughan;Joëlle Barido-Sottani;Sebastián Duchêne;Mathieu Fourment;Alexandra Gavryushkina;Joseph Heled;Graham Jones;Denise Kühnert;Nicola De Maio;Michael Matschiner;Fábio K. Mendes;Nicola F. Müller;Huw A. Ogilvie;Louis du Plessis;Alex Popinga;Andrew Rambaut;David Rasmussen;Igor Siveroni;Marc A. Suchard;Chieh-Hsi Wu;Dong Xie;Chi Zhang;Tanja Stadler;Alexei J. Drummond
- 期刊名称：《PLoS Computational Biology》 | 2019年第4期
9.Self-organization of conducting pathways explains electrical wave propagation in cardiac tissues with high fraction of non-conducting cells

机译：传导通路的自组织解释了电波在心脏组织中具有大量非传导细胞的传播
- 作者：Nina Kudryashova;Aygul Nizamieva;Valeriya Tsvelaya;Alexander V. Panfilov;Konstantin I. Agladze
- 期刊名称：《PLoS Computational Biology》 | 2019年第3期
10.The finite state projection based Fisher information matrix approach to estimate information and optimize single-cell experiments

机译：基于有限状态投影的Fisher信息矩阵方法来估计信息并优化单细胞实验
- 作者：Zachary R Fox;Brian Munsky
- 期刊名称：《PLoS Computational Biology》 | 2019年第1期
11.Conservation of conformational dynamics across prokaryotic actins

机译：跨原核肌动蛋白的构象动力学的守恒
- 作者：Natalie Ng;Handuo Shi;Alexandre Colavin;Kerwyn Casey Huang
- 期刊名称：《PLoS Computational Biology》 | 2019年第4期
12.Goal-related feedback guides motor exploration and redundancy resolution in human motor skill acquisition

机译：与目标相关的反馈指导人类运动技能获取中的运动探索和冗余解决方案
- 作者：Marieke Rohde;Kenichi Narioka;Jochen J. Steil;Lina K. Klein;Marc O. Ernst
- 期刊名称：《PLoS Computational Biology》 | 2019年第3期
13.Context-explorer: Analysis of spatially organized protein expression in high-throughput screens

机译：Context-explorer：高通量筛选中空间组织的蛋白质表达分析
- 作者：Joel Ostblom;Emanuel J. P. Nazareth;Mukul Tewary;Peter W. Zandstra
- 期刊名称：《PLoS Computational Biology》 | 2019年第1期
14.Dynamic filopodial forces induce accumulation damage and plastic remodeling of 3D extracellular matrices

机译：动态丝虫力量诱导3D细胞外基质的积累损伤和塑性重塑
- 作者：Andrea Malandrino;Xavier Trepat;Roger D. Kamm;Michael Mak
- 期刊名称：《PLoS Computational Biology》 | 2019年第4期
15.New functionalities in the TCGAbiolinks package for the study and integration of cancer data from GDC and GTEx

机译：TCGAbiolinks软件包中的新功能可用于研究和整合来自GDC和GTEx的癌症数据
- 作者：Mohamed Mounir;Marta Lucchetta;Tiago C. Silva;Catharina Olsen;Gianluca Bontempi;Xi Chen;Houtan Noushmehr;Antonio Colaprico;Elena Papaleo
- 期刊名称：《PLoS Computational Biology》 | 2019年第3期
16.Sour grapes and sweet victories: How actions shape preferences

机译：酸葡萄和甜蜜的胜利：行动如何影响偏好
- 作者：Fabien Vinckier;Lionel Rigoux;Irma T. Kurniawan;Chen Hu;Sacha Bourgeois-Gironde;Jean Daunizeau;Mathias Pessiglione
- 期刊名称：《PLoS Computational Biology》 | 2019年第1期
17.Stytra: An open-source integrated system for stimulation tracking and closed-loop behavioral experiments

机译：Stytra：用于刺激跟踪和闭环行为实验的开源集成系统
- 作者：Vilim Štih;Luigi Petrucco;Andreas M. Kist;Ruben Portugues
- 期刊名称：《PLoS Computational Biology》 | 2019年第4期
18.An agent-based model of dengue virus transmission shows how uncertainty about breakthrough infections influences vaccination impact projections

机译：基于代理的登革热病毒传播模型显示突破性感染的不确定性如何影响疫苗接种影响预测
- 作者：T. Alex Perkins;Robert C. Reiner Jr.;Guido España;Quirine A. ten Bosch;Amit Verma;Kelly A. Liebman;Valerie A. Paz-Soldan;John P. Elder;Amy C. Morrison;Steven T. Stoddard;Uriel Kitron;Gonzalo M. Vazquez-Prokopec;Thomas W. Scott;David L. Smith
- 期刊名称：《PLoS Computational Biology》 | 2019年第3期
19.Sequential infection experiments for quantifying innate and adaptive immunity during influenza infection

机译：顺序感染实验用于量化流感感染期间的先天和适应性免疫
- 作者：Ada W. C. Yan;Sophie G. Zaloumis;Julie A. Simpson;James M. McCaw
- 期刊名称：《PLoS Computational Biology》 | 2019年第1期
20.Learning and forgetting using reinforced Bayesian change detection

机译：使用增强的贝叶斯变化检测来学习和忘记
- 作者：Vincent Moens;Alexandre Zénon
- 期刊名称：《PLoS Computational Biology》 | 2019年第4期
21.A stochastic simulation of skeletal muscle calcium transients in a structurally realistic sarcomere model using MCell

机译：使用MCell的结构逼真的肌节模型中骨骼肌钙瞬变的随机模拟
- 作者：Robert John Holash;Brian R. MacIntosh
- 期刊名称：《PLoS Computational Biology》 | 2019年第3期
22.Multi-study inference of regulatory networks for more accurate models of gene regulation

机译：调控网络的多研究推断可提供更精确的基因调控模型
- 作者：Dayanne M. Castro;Nicholas R. de Veaux;Emily R. Miraldi;Richard Bonneau
- 期刊名称：《PLoS Computational Biology》 | 2019年第1期
23.Evolutionary model for the unequal segregation of high copy plasmids

机译：高拷贝质粒不平等分离的进化模型
- 作者：Karin Münch;Richard Münch;Rebekka Biedendieck;Dieter Jahn;Johannes Müller
- 期刊名称：《PLoS Computational Biology》 | 2019年第3期
24.Investigating the deregulation of metabolic tasks via Minimum Network Enrichment Analysis (MiNEA) as applied to nonalcoholic fatty liver disease using mouse and human omics data

机译：通过最小网络富集分析（MiNEA）使用小鼠和人类组学数据研究用于非酒精性脂肪肝疾病的代谢任务的放松管制
- 作者：Vikash Pandey;Vassily Hatzimanikatis
- 期刊名称：《PLoS Computational Biology》 | 2019年第4期
25.STRFs in primary auditory cortex emerge from masking-based statistics of natural sounds

机译：初级听觉皮层的STRFs来自基于遮罩的自然声音统计
- 作者：Abdul-Saboor Sheikh;Nicol S. Harper;Jakob Drefs;Yosef Singer;Zhenwen Dai;Richard E. Turner;Jörg Lücke
- 期刊名称：《PLoS Computational Biology》 | 2019年第1期
26.Computational geometry for modeling neural populations: From visualization to simulation

机译：用于建模神经种群的计算几何：从可视化到仿真
- 作者：Marc de Kamps;Mikkel Lepperød;Yi Ming Lai
- 期刊名称：《PLoS Computational Biology》 | 2019年第3期
27.Multiple factors influence the morphology of the bipolar electrogram: An in silico modeling study

机译：多因素影响双极电描记图的形态：计算机模拟研究
- 作者：Minki Hwang;Jaehyuk Kim;Byounghyun Lim;Jun-Seop Song;Boyoung Joung;Eun Bo Shim;Hui-Nam Pak
- 期刊名称：《PLoS Computational Biology》 | 2019年第4期
28.Whole genomes define concordance of matched primary xenograft and organoid models of pancreas cancer

机译：整个基因组定义了匹配的胰腺癌原发异种移植和类器官模型的一致性
- 作者：Deena M. A. Gendoo;Robert E. Denroche;Amy Zhang;Nikolina Radulovich;Gun Ho Jang;Mathieu Lemire;Sandra Fischer;Dianne Chadwick;Ilinca M. Lungu;Emin Ibrahimov;Ping-Jiang Cao;Lincoln D. Stein;Julie M. Wilson;John M. S. Bartlett;Ming-Sound Tsao;Neesha Dhani;David Hedley;Steven Gallinger;Benjamin Haibe-Kains
- 期刊名称：《PLoS Computational Biology》 | 2019年第1期
29.Synchrony is more than its top-down and climatic parts: interacting Moran effects on phytoplankton in British seas

机译：同步不仅仅是其自上而下和气候的一部分：相互作用的莫兰效应对英国海域浮游植物的影响
- 作者：Lawrence W. Sheppard;Emma J. Defriez;Philip C. Reid;Daniel C. Reuman
- 期刊名称：《PLoS Computational Biology》 | 2019年第3期
30.The intrinsic dimension of protein sequence evolution

机译：蛋白质序列进化的内在维度
- 作者：Elena Facco;Andrea Pagnani;Elena Tea Russo;Alessandro Laio
- 期刊名称：《PLoS Computational Biology》 | 2019年第4期
31.Differential mobility and local variation in infection attack rate

机译：差异迁移率和感染发作率的局部变化
- 作者：David J. Haw;Derek A. T. Cummings;Justin Lessler;Henrik Salje;Jonathan M. Read;Steven Riley
- 期刊名称：《PLoS Computational Biology》 | 2019年第1期
32.A dynamic power-law sexual network model of gonorrhoea outbreaks

机译：淋病暴发的动态幂律性网络模型
- 作者：Lilith K. Whittles;Peter J. White;Xavier Didelot
- 期刊名称：《PLoS Computational Biology》 | 2019年第3期
33.Structure stability and specificity of the binding of ssDNA and ssRNA with proteins

机译：ssDNA和ssRNA与蛋白质结合的结构稳定性和特异性
- 作者：Arumay Pal;Yaakov Levy
- 期刊名称：《PLoS Computational Biology》 | 2019年第4期
34.Top-down inputs drive neuronal network rewiring and context-enhanced sensory processing in olfaction

机译：自上而下的输入驱动嗅觉中的神经元网络重新布线和上下文增强的感觉处理
- 作者：Wayne Adams;James N. Graham;Xuchen Han;Hermann Riecke
- 期刊名称：《PLoS Computational Biology》 | 2019年第1期
35.Stochastic neural field model of stimulus-dependent variability in cortical neurons

机译：皮层神经元刺激依赖性变异的随机神经场模型
- 作者：Paul C. Bressloff
- 期刊名称：《PLoS Computational Biology》 | 2019年第3期
36.Leveraging heterogeneity for neural computation with fading memory in layer 2/3 cortical microcircuits

机译：在第2/3层皮质微电路中利用异质性进行神经计算和衰落记忆
- 作者：Renato Duarte;Abigail Morrison
- 期刊名称：《PLoS Computational Biology》 | 2019年第4期
37.Deep image reconstruction from human brain activity

机译：通过人脑活动进行深度图像重建
- 作者：Guohua Shen;Tomoyasu Horikawa;Kei Majima;Yukiyasu Kamitani
- 期刊名称：《PLoS Computational Biology》 | 2019年第1期
38.Tuft dendrites of pyramidal neurons operate as feedback-modulated functional subunits

机译：锥体神经元的簇状树突起反馈调节功能亚基的作用
- 作者：Florian Eberhardt;Andreas V. M. Herz;Stefan Häusler
- 期刊名称：《PLoS Computational Biology》 | 2019年第3期
39.Inferring neural circuit structure from datasets of heterogeneous tuning curves

机译：从异构调谐曲线的数据集推断神经回路结构
- 作者：Takafumi Arakaki;G. Barello;Yashar Ahmadian
- 期刊名称：《PLoS Computational Biology》 | 2019年第4期
40.Using the drug-protein interactome to identify anti-ageing compounds for humans

机译：使用药物-蛋白质相互作用组鉴定人类抗衰老化合物
- 作者：Matías Fuentealba;Handan Melike Dönertaş;Rhianna Williams;Johnathan Labbadia;Janet M. Thornton;Linda Partridge
- 期刊名称：《PLoS Computational Biology》 | 2019年第1期
41.In vitro and in silico multidimensional modeling of oncolytic tumor virotherapy dynamics

机译：溶瘤肿瘤病毒治疗动力学的体外和计算机模拟多维模型
- 作者：David R. Berg;Chetan P. Offord;Iris Kemler;Matthew K. Ennis;Lawrence Chang;George Paulik;Zeljko Bajzer;Claudia Neuhauser;David Dingli
- 期刊名称：《PLoS Computational Biology》 | 2019年第3期
42.The life history of learning: Demographic structure changes cultural outcomes

机译：学习的生活史：人口结构改变文化结果
- 作者：Laurel Fogarty;Nicole Creanza;Marcus W. Feldman
- 期刊名称：《PLoS Computational Biology》 | 2019年第4期
43.A computational knowledge-base elucidates the response of Staphylococcus aureus to different media types

机译：计算知识库阐明了金黄色葡萄球菌对不同培养基类型的反应
- 作者：Yara Seif;Jonathan M. Monk;Nathan Mih;Hannah Tsunemoto;Saugat Poudel;Cristal Zuniga;Jared Broddrick;Karsten Zengler;Bernhard O. Palsson
- 期刊名称：《PLoS Computational Biology》 | 2019年第1期
44.Modeling individual time courses of thrombopoiesis during multi-cyclic chemotherapy

机译：模拟多周期化疗过程中血小板生成的个别时间过程
- 作者：Yuri Kheifetz;Markus Scholz
- 期刊名称：《PLoS Computational Biology》 | 2019年第3期
45.Finding the balance between model complexity and performance: Using ventral striatal oscillations to classify feeding behavior in rats

机译：在模型复杂性和性能之间找到平衡：使用腹侧纹状体振荡对大鼠的进食行为进行分类
- 作者：Lucas L. Dwiel;Jibran Y. Khokhar;Michael A. Connerney;Alan I. Green;Wilder T. Doucette
- 期刊名称：《PLoS Computational Biology》 | 2019年第4期
46.Epithelial stratification shapes infection dynamics

机译：上皮分层塑造感染动态
- 作者：Carmen Lía Murall;Robert Jackson;Ingeborg Zehbe;Nathalie Boulle;Michel Segondy;Samuel Alizon
- 期刊名称：《PLoS Computational Biology》 | 2019年第1期
47.Analyzing the symmetrical arrangement of structural repeats in proteins with CE-Symm

机译：用CE-Symm分析蛋白质中结构重复的对称排列
- 作者：Spencer E. Bliven;Aleix Lafita;Peter W. Rose;Guido Capitani;Andreas Prlić;Philip E. Bourne
- 期刊名称：《PLoS Computational Biology》 | 2019年第4期
48.Spatial clustering and common regulatory elements correlate with coordinated gene expression

机译：空间聚类和共同调控元素与协调基因表达相关。
- 作者：Jingyu Zhang;Hengyu Chen;Ruoyan Li;David A. Taft;Guang Yao;Fan Bai;Jianhua Xing
- 期刊名称：《PLoS Computational Biology》 | 2019年第3期
49.Global analysis of N6-methyladenosine functions and its disease association using deep learning and network-based methods

机译：使用深度学习和基于网络的方法对N6-甲基腺苷功能及其疾病关联进行全局分析
- 作者：Song-Yao Zhang;Shao-Wu Zhang;Xiao-Nan Fan;Jia Meng;Yidong Chen;Shou-Jiang Gao;Yufei Huang
- 期刊名称：《PLoS Computational Biology》 | 2019年第1期
50.Assessing intra-lab precision and inter-lab repeatability of outgrowth assays of HIV-1 latent reservoir size

机译：评估HIV-1潜在储层大小的实验室分析的实验室内精度和实验室间可重复性
- 作者：Daniel I. S. Rosenbloom;Peter Bacchetti;Mars Stone;Xutao Deng;Ronald J. Bosch;Douglas D. Richman;Janet D. Siliciano;John W. Mellors;Steven G. Deeks;Roger G. Ptak;Rebecca Hoh;Sheila M. Keating;Melanie Dimapasoc;Marta Massanella;Jun Lai;Michele D. Sobolewski;Deanna A. Kulpa;Michael P. Busch
- 期刊名称：《PLoS Computational Biology》 | 2019年第4期
51.A complete statistical model for calibration of RNA-seq counts using external spike-ins and maximum likelihood theory

机译：使用外部刺入和最大似然理论对RNA-seq计数进行校准的完整统计模型
- 作者：Rodoniki Athanasiadou;Benjamin Neymotin;Nathan Brandt;Wei Wang;Lionel Christiaen;David Gresham;Daniel Tranchina
- 期刊名称：《PLoS Computational Biology》 | 2019年第3期
52.Mutation drift and selection in single-driver hematologic malignancy: Example of secondary myelodysplastic syndrome following treatment of inherited neutropenia

机译：单人血液系统恶性肿瘤的突变漂移和选择：遗传性中性粒细胞减少症治疗后继发性骨髓增生异常综合征的实例
- 作者：Tomasz Wojdyla;Hrishikesh Mehta;Taly Glaubach;Roberto Bertolusso;Marta Iwanaszko;Rosemary Braun;Seth J. Corey;Marek Kimmel
- 期刊名称：《PLoS Computational Biology》 | 2019年第1期
53.Competing evolutionary paths in growing populations with applications to multidrug resistance

机译：在人口增长中竞争进化途径并应用于多药耐药性
- 作者：Michael D. Nicholson;Tibor Antal
- 期刊名称：《PLoS Computational Biology》 | 2019年第4期
54.Bacterial surface colonization preferential attachment and fitness under periodic stress

机译：细菌在表面压力下的定殖优先附着和适应
- 作者：Maor Grinberg;Tomer Orevi;Nadav Kashtan
- 期刊名称：《PLoS Computational Biology》 | 2019年第3期
55.On identifying collective displacements in apo-proteins that reveal eventual binding pathways

机译：在鉴定载脂蛋白的集体置换中揭示最终的结合途径
- 作者：Dheeraj Dube;Navjeet Ahalawat;Himanshu Khandelia;Jagannath Mondal;Surajit Sengupta
- 期刊名称：《PLoS Computational Biology》 | 2019年第1期
56.Increasing consensus of context-specific metabolic models by integrating data-inferred cell functions

机译：通过整合数据推断的细胞功能增加针对特定情境的代谢模型的共识
- 作者：Anne Richelle;Austin W. T. Chiang;Chih-Chung Kuo;Nathan E. Lewis
- 期刊名称：《PLoS Computational Biology》 | 2019年第4期
57.Optimizing the depth and the direction of prospective planning using information values

机译：利用信息值优化预期计划的深度和方向
- 作者：Can Eren Sezener;Amir Dezfouli;Mehdi Keramati
- 期刊名称：《PLoS Computational Biology》 | 2019年第3期
58.Short-term synaptic depression can increase the rate of information transfer at a release site

机译：短期突触抑制可增加释放部位的信息传递速率
- 作者：Mehrdad Salmasi;Alex Loebel;Stefan Glasauer;Martin Stemmler
- 期刊名称：《PLoS Computational Biology》 | 2019年第1期
59.Inferring rates of metastatic dissemination using stochastic network models

机译：使用随机网络模型推断转移扩散的速率
- 作者：Philip Gerlee;Mia Johansson
- 期刊名称：《PLoS Computational Biology》 | 2019年第4期
60.Scalable nonlinear programming framework for parameter estimation in dynamic biological system models

机译：动态生物系统模型中参数估计的可扩展非线性规划框架
- 作者：Sungho Shin;Ophelia S. Venturelli;Victor M. Zavala
- 期刊名称：《PLoS Computational Biology》 | 2019年第3期
61.Dynamical differential expression (DyDE) reveals the period control mechanisms of the Arabidopsis circadian oscillator

机译：动态差异表达（DyDE）揭示了拟南芥生物钟振荡器的周期控制机制
- 作者：Laurent Mombaerts;Alberto Carignano;Fiona C. Robertson;Timothy J. Hearn;Jin Junyang;David Hayden;Zoe Rutterford;Carlos T. Hotta;Katherine E. Hubbard;Marti Ruiz C. Maria;Ye Yuan;Matthew A. Hannah;Jorge Goncalves;Alex A. R. Webb
- 期刊名称：《PLoS Computational Biology》 | 2019年第1期
62.Integrated computational and Drosophila cancer model platform captures previously unappreciated chemicals perturbing a kinase network

机译：集成的计算和果蝇癌症模型平台可捕获先前未发现的扰动激酶网络的化学物质
- 作者：Peter M. U. Ung;Masahiro Sonoshita;Alex P. Scopton;Arvin C. Dar;Ross L. Cagan;Avner Schlessinger
- 期刊名称：《PLoS Computational Biology》 | 2019年第4期
63.A computational model to understand mouse iron physiology and disease

机译：理解小鼠铁生理和疾病的计算模型
- 作者：Jignesh H. Parmar;Pedro Mendes
- 期刊名称：《PLoS Computational Biology》 | 2019年第1期
64.Modeling second-order boundary perception: A machine learning approach

机译：建模二阶边界感知：一种机器学习方法
- 作者：Christopher DiMattina;Curtis L. Baker Jr.
- 期刊名称：《PLoS Computational Biology》 | 2019年第3期
65.Predicting synthetic lethal interactions using conserved patterns in protein interaction networks

机译：使用蛋白质相互作用网络中的保守模式预测合成致死相互作用
- 作者：Graeme Benstead-Hume;Xiangrong Chen;Suzanna R. Hopkins;Karen A. Lane;Jessica A. Downs;Frances M. G. Pearl
- 期刊名称：《PLoS Computational Biology》 | 2019年第4期
66.Systems biology reveals how altered TGFβ signalling with age reduces protection against pro-inflammatory stimuli

机译：系统生物学揭示了随着年龄的增长而改变的TGFβ信号传导如何降低对促炎性刺激的保护
- 作者：David Hodgson;Andrew D. Rowan;Francesco Falciani;Carole J. Proctor
- 期刊名称：《PLoS Computational Biology》 | 2019年第1期
67.Effectiveness of Ultra-Low Volume insecticide spraying to prevent dengue in a non-endemic metropolitan area of Brazil

机译：超低剂量杀虫剂喷雾在巴西非疫区预防登革热的有效性
- 作者：Giovanni Marini;Giorgio Guzzetta;Cecilia A. Marques Toledo;Mauro Teixeira;Roberto Rosà;Stefano Merler
- 期刊名称：《PLoS Computational Biology》 | 2019年第3期
68.Toward a 3D model of phyllotaxis based on a biochemically plausible auxin-transport mechanism

机译：基于生化看来可行的生长素转运机制建立的3D花序轴模型
- 作者：Félix P. Hartmann;Pierre Barbier de Reuille;Cris Kuhlemeier
- 期刊名称：《PLoS Computational Biology》 | 2019年第4期
69.Cellular determinants of metabolite concentration ranges

机译：细胞代谢物浓度范围的决定因素
- 作者：Anika Küken;Jeanne M. O. Eloundou-Mbebi;Georg Basler;Zoran Nikoloski
- 期刊名称：《PLoS Computational Biology》 | 2019年第1期
70.Pan-cancer association of a centrosome amplification gene expression signature with genomic alterations and clinical outcome

机译：中心体扩增基因表达特征与基因组改变和临床结果的全癌联系
- 作者：Bernardo P. de Almeida;André F. Vieira;Joana Paredes;Mónica Bettencourt-Dias;Nuno L. Barbosa-Morais
- 期刊名称：《PLoS Computational Biology》 | 2019年第3期
71.Deep convolutional models improve predictions of macaque V1 responses to natural images

机译：深度卷积模型改善了猕猴V1对自然图像响应的预测
- 作者：Santiago A. Cadena;George H. Denfield;Edgar Y. Walker;Leon A. Gatys;Andreas S. Tolias;Matthias Bethge;Alexander S. Ecker
- 期刊名称：《PLoS Computational Biology》 | 2019年第4期
72.A spectrum of routing strategies for brain networks

机译：脑网络的一系列路由策略
- 作者：Andrea Avena-Koenigsberger;Xiaoran Yan;Artemy Kolchinsky;Martijn P. van den Heuvel;Patric Hagmann;Olaf Sporns
- 期刊名称：《PLoS Computational Biology》 | 2019年第3期
73.Generalizing clusters of similar species as a signature of coexistence under competition

机译：竞争中共存相似物种的集群作为共存的标志
- 作者：Rafael D’Andrea;Maria Riolo;Annette M. Ostling
- 期刊名称：《PLoS Computational Biology》 | 2019年第1期
74.Kinetic and thermodynamic insights into sodium ion translocation through the μ-opioid receptor from molecular dynamics and machine learning analysis

机译：动力学和热力学对分子动力学和机器学习分析中通过μ阿片受体进行钠离子转运的见解
- 作者：Xiaohu Hu;Yibo Wang;Amanda Hunkele;Davide Provasi;Gavril W. Pasternak;Marta Filizola
- 期刊名称：《PLoS Computational Biology》 | 2019年第1期
75.Synaptic plasticity onto inhibitory neurons as a mechanism for ocular dominance plasticity

机译：抑制性神经元的突触可塑性作为眼优势可塑性的一种机制
- 作者：Jacopo Bono;Claudia Clopath
- 期刊名称：《PLoS Computational Biology》 | 2019年第3期
76.Gene set meta-analysis with Quantitative Set Analysis for Gene Expression (QuSAGE)

机译：利用基因表达定量集分析（QuSAGE）进行基因集荟萃分析
- 作者：Hailong Meng;Gur Yaari;Christopher R. Bolen;Stefan Avey;Steven H. Kleinstein
- 期刊名称：《PLoS Computational Biology》 | 2019年第4期
77.OpenCASA: A new open-source and scalable tool for sperm quality analysis

机译：OpenCASA：用于精子质量分析的新的开源可扩展工具
- 作者：Carlos Alquézar-Baeta;Silvia Gimeno-Martos;Sara Miguel-Jiménez;Pilar Santolaria;Jesús Yániz;Inmaculada Palacín;Adriana Casao;José Álvaro Cebrián-Pérez;Teresa Muiño-Blanco;Rosaura Pérez-Pé
- 期刊名称：《PLoS Computational Biology》 | 2019年第1期
78.OptRAM: In-silico strain design via integrative regulatory-metabolic network modeling

机译：OptRAM：通过集成的调节代谢网络建模进行硅内应变设计
- 作者：Fangzhou Shen;Renliang Sun;Jie Yao;Jian Li;Qian Liu;Nathan D. Price;Chenguang Liu;Zhuo Wang
- 期刊名称：《PLoS Computational Biology》 | 2019年第3期
79.Rich-club connectivity diverse population coupling and dynamical activity patterns emerging from local cortical circuits

机译：富人俱乐部的连通性多样化的人口耦合以及局部皮层回路形成的动态活动模式
- 作者：Yifan Gu;Yang Qi;Pulin Gong
- 期刊名称：《PLoS Computational Biology》 | 2019年第4期
80.The gradient of the reinforcement landscape influences sensorimotor learning

机译：加固景观的梯度影响感觉运动学习
- 作者：Joshua G. A. Cashaback;Christopher K. Lao;Dimitrios J. Palidis;Susan K. Coltman;Heather R. McGregor;Paul L. Gribble
- 期刊名称：《PLoS Computational Biology》 | 2019年第3期
81.A diurnal flux balance model of Synechocystis sp.PCC 6803 metabolism

机译：圆孢藻的日通量平衡模型。PCC 6803代谢
- 作者：Debolina Sarkar;Thomas J. Mueller;Deng Liu;Himadri B. Pakrasi;Costas D. Maranas
- 期刊名称：《PLoS Computational Biology》 | 2019年第1期
82.Neural control of body-plan axis in regenerating planaria

机译：平面肌轴再生中的神经控制
- 作者：Alexis Pietak;Johanna Bischof;Joshua LaPalme;Junji Morokuma;Michael Levin
- 期刊名称：《PLoS Computational Biology》 | 2019年第4期
83.Modeling differentiation-state transitions linked to therapeutic escape in triple-negative breast cancer

机译：与三阴性乳腺癌的治疗逃逸相关的分化状态转换建模
- 作者：Margaret P. Chapman;Tyler Risom;Anil J. Aswani;Ellen M. Langer;Rosalie C. Sears;Claire J. Tomlin
- 期刊名称：《PLoS Computational Biology》 | 2019年第3期
84.Protein—protein binding supersites

机译：蛋白质—蛋白质结合超位点
- 作者：Raji Viswanathan;Eduardo Fajardo;Gabriel Steinberg;Matthew Haller;Andras Fiser
- 期刊名称：《PLoS Computational Biology》 | 2019年第1期
85.Clonal hematopoiesis of indeterminate potential and its impact on patient trajectories after stem cell transplantation

机译：干细胞移植后潜在的克隆性造血作用及其对患者轨迹的影响
- 作者：Derek S. Park;Afua A. Akuffo;David E. Muench;H. Leighton Grimes;Pearlie K. Epling-Burnette;Philip K. Maini;Alexander R. A. Anderson;Michael B. Bonsall
- 期刊名称：《PLoS Computational Biology》 | 2019年第4期
86.Modeling neuronal avalanches and long-range temporal correlations at the emergence of collective oscillations: Continuously varying exponents mimic M/EEG results

机译：在集体振荡出现时对神经元雪崩和长期时间相关性进行建模：连续变化的指数模仿M / EEG结果
- 作者：Leonardo Dalla Porta;Mauro Copelli
- 期刊名称：《PLoS Computational Biology》 | 2019年第4期
87.Inherent versus induced protein flexibility: Comparisons within and between apo and holo structures

机译：固有的与诱导的蛋白质柔韧性：载脂蛋白和完整结构内部以及之间的比较
- 作者：Jordan J. Clark;Mark L. Benson;Richard D. Smith;Heather A. Carlson
- 期刊名称：《PLoS Computational Biology》 | 2019年第1期
88.A new clustering and nomenclature for beta turns derived from high-resolution protein structures

机译：来自高分辨率蛋白质结构的β转向的新聚类和命名法
- 作者：Maxim Shapovalov;Slobodan Vucetic;Roland L. Dunbrack Jr.
- 期刊名称：《PLoS Computational Biology》 | 2019年第3期
89.Stability of working memory in continuous attractor networks under the control of short-term plasticity

机译：短期可塑性控制下连续吸引网络中工作记忆的稳定性
- 作者：Alexander Seeholzer;Moritz Deger;Wulfram Gerstner
- 期刊名称：《PLoS Computational Biology》 | 2019年第4期
90.Predicting the mechanism and rate of H-NS binding to AT-rich DNA

机译：预测H-NS与富含AT的DNA结合的机理和速率
- 作者：Enrico Riccardi;Eva C. van Mastbergen;William Wiley Navarre;Jocelyne Vreede
- 期刊名称：《PLoS Computational Biology》 | 2019年第3期
91.Modeling cell line-specific recruitment of signaling proteins to the insulin-like growth factor 1 receptor

机译：建模信号线蛋白向胰岛素样生长因子1受体的细胞系特异性募集
- 作者：Keesha E. Erickson;Oleksii S. Rukhlenko;Md Shahinuzzaman;Kalina P. Slavkova;Yen Ting Lin;Ryan Suderman;Edward C. Stites;Marian Anghel;Richard G. Posner;Dipak Barua;Boris N. Kholodenko;William S. Hlavacek
- 期刊名称：《PLoS Computational Biology》 | 2019年第1期
92.Adaptive multi-view multi-label learning for identifying disease-associated candidate miRNAs

机译：自适应多视图多标签学习用于识别与疾病相关的候选miRNA
- 作者：Cheng Liang;Shengpeng Yu;Jiawei Luo
- 期刊名称：《PLoS Computational Biology》 | 2019年第4期
93.Predicting change: Approximate inference under explicit representation of temporal structure in changing environments

机译：预测变化：在变化的环境中时间结构的显式表示下的近似推断
- 作者：Dimitrije Marković;Andrea M. F. Reiter;Stefan J. Kiebel
- 期刊名称：《PLoS Computational Biology》 | 2019年第1期
94.Searching algorithm for Type IV effector proteins (S4TE) 2.0: Improved tools for Type IV effector prediction analysis and comparison in proteobacteria

机译：IV型效应子蛋白（S4TE）2.0的搜索算法：改进的工具用于蛋白质细菌中IV型效应子的预测分析和比较
- 作者：Christophe Noroy;Thierry Lefrançois;Damien F. Meyer
- 期刊名称：《PLoS Computational Biology》 | 2019年第3期
95.Temporal pattern separation in hippocampal neurons through multiplexed neural codes

机译：海马神经元的时空模式分离
- 作者：Antoine D. Madar;Laura A. Ewell;Mathew V. Jones
- 期刊名称：《PLoS Computational Biology》 | 2019年第4期
96.Thermodynamic model of gene regulation for the Or59b olfactory receptor in Drosophila

机译：果蝇Or59b嗅觉受体基因调控的热力学模型。
- 作者：Alejandra González;Shadi Jafari;Alberto Zenere;Mattias Alenius;Claudio Altafini
- 期刊名称：《PLoS Computational Biology》 | 2019年第1期
97.Predicting proteome allocation overflow metabolism and metal requirements in a model acetogen

机译：预测模型丙酮原中的蛋白质组分配溢流代谢和金属需求
- 作者：Joanne K. Liu;Colton Lloyd;Mahmoud M. Al-Bassam;Ali Ebrahim;Ji-Nu Kim;Connor Olson;Alexander Aksenov;Pieter Dorrestein;Karsten Zengler
- 期刊名称：《PLoS Computational Biology》 | 2019年第3期
98.A benchmark-driven approach to reconstruct metabolic networks for studying cancer metabolism

机译：一种基准驱动的方法来重建用于研究癌症代谢的代谢网络
- 作者：Oveis Jamialahmadi;Sameereh Hashemi-Najafabadi;Ehsan Motamedian;Stefano Romeo;Fatemeh Bagheri
- 期刊名称：《PLoS Computational Biology》 | 2019年第4期
99.A Gestalt inference model for auditory scene segregation

机译：用于听觉场景隔离的格式塔推理模型
- 作者：Debmalya Chakrabarty;Mounya Elhilali
- 期刊名称：《PLoS Computational Biology》 | 2019年第1期
100.Humans use multi-objective control to regulate lateral foot placement when walking

机译：人类在行走时使用多目标控制来调节脚的外侧位置
- 作者：Jonathan B. Dingwell;Joseph P. Cusumano
- 期刊名称：《PLoS Computational Biology》 | 2019年第3期