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构建细胞代谢产物网络的新算法

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摘要

构建细胞代谢产物网络的新算法，本发明根据已知的代谢通路，将其整合生成一个完整的代谢网络。可以全局上观察代谢物之间的关系，对于分析代谢通路之间的互作具有指导意义。本发明主要包括如下流程：步骤1：获得代谢组学实验数据；步骤2：根据筛选标准，选择差异表达的代谢物；步骤3：对代谢物进行代谢通路分析；步骤4：分离每个代谢通路中代谢物之间的关系；步骤5：构建代谢网络；步骤6：使用cytoscape软件生成最终的网络结果。

著录项

  • 公开/公告号CN103186718A

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2013-07-03

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 上海聚类生物科技有限公司;

    申请/专利号CN201110458950.5

  • 发明设计人 刘极龙;

    申请日2011-12-29

  • 分类号G06F19/26;

  • 代理机构

  • 代理人

  • 地址 200333 上海市祁连山南路999弄80号801室

  • 入库时间 2024-02-19 18:48:14

法律信息

  • 法律状态公告日

    法律状态信息

    法律状态

  • 2015-08-19

    发明专利申请公布后的视为撤回 IPC(主分类):G06F19/26 申请公布日:20130703 申请日:20111229

    发明专利申请公布后的视为撤回

  • 2013-07-03

    公开

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