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基于三维空间静电势重构的新型蛋白质粗粒化计算方法

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摘要

本发明涉及基于三维空间静电势重构的新型蛋白质粗粒化计算方法，包括以下步骤：首先计算不规则表面蛋白质表面离散点电荷的位置；然后将该离散点电荷进行优化并采用最小二乘法得到优化的点电荷的电量，得到蛋白质粗粒化的结果；根据优化后的点电荷的电量和位置生成蛋白质周围静电势，最后根据其与蛋白质周围原有的静电势之间的误差评判所得蛋白质粗粒化结果。本发明通过少数的点电荷对不规则表面蛋白质的表面进行离散，简化了蛋白质表面的重构；通过最小二乘的原则得到离散点电荷，在可以接受的误差范围内，大大的减少了动力学模型和能量分析过程中的计算量。

著录项

  • 公开/公告号CN103886226A

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2014-06-25

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 中国科学院大连化学物理研究所;

    申请/专利号CN201210563541.6

  • 发明设计人 李国辉;仲心珏;李焱;沈虎俊;张鼎林;

    申请日2012-12-21

  • 分类号G06F19/10;

  • 代理机构沈阳科苑专利商标代理有限公司;

  • 代理人许宗富

  • 地址 116023 辽宁省大连市中山路457号

  • 入库时间 2024-02-20 00:20:11

法律信息

  • 法律状态公告日

    法律状态信息

    法律状态

  • 2017-04-19

    发明专利申请公布后的视为撤回 IPC(主分类):G06F19/10 申请公布日:20140625 申请日:20121221

    发明专利申请公布后的视为撤回

  • 2014-07-16

    实质审查的生效 IPC(主分类):G06F19/10 申请日:20121221

    实质审查的生效

  • 2014-06-25

    公开

    公开

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