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Docker技术在高通量测序数据分析中的应用

摘要

本发明公开了Docker技术在高通量测序数据分析中的应用,属于生物计算学及分子生物学领域。使用Docker先构建基础镜像,再将分析所需软件、语言在交互模式下保存到镜像中;搭建分析流程后,再生成生物云计算平台镜像;将其保存为tar压缩包上传并导入到需要进行分析的服务器目录,再将需要分析的数据信息及数据注释文件挂载到镜像中,调用配置好的分析流程即可对数据进行分析。本发明将Docker技术应用于高通量测序数据分析,可以解决现有生物大数据分析中存在的软件安装、配置、迁移及所依赖的计算机资源差异等局限性问题,使得研究人员能够高效的对生物测序大数据进行挖掘分析,减少了对分析手段本身处理的时间。

著录项

  • 公开/公告号CN107590365A

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2018-01-16

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 武汉古奥基因科技有限公司;

    申请/专利号CN201710722110.2

  • 发明设计人 袁晓辉;

    申请日2017-08-22

  • 分类号G06F19/28(20110101);

  • 代理机构武汉蓝宝石专利代理事务所(特殊普通合伙);

  • 代理人常海涛

  • 地址 430000 湖北省武汉市洪山区珞狮南路南国雄楚广场A1栋1601

  • 入库时间 2023-06-19 04:19:09

法律信息

  • 法律状态公告日

    法律状态信息

    法律状态

  • 2019-12-17

    发明专利申请公布后的撤回 IPC(主分类):G06F19/28 申请公布日:20180116 申请日:20170822

    发明专利申请公布后的撤回

  • 2018-02-09

    实质审查的生效 IPC(主分类):G06F19/28 申请日:20170822

    实质审查的生效

  • 2018-01-16

    公开

    公开

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