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一种基于三代测序技术的宏基因组测序数据的自动化分析方法

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本发明公开了一种基于三代测序技术的宏基因组测序数据自动化分析方法，包括以下步骤：1）原始三代测序数据进行质量控制，得到clean reads；2）对clean reads拼接组装得到contigs序列；3）对contigs进行纠错优化；4）对优化后的contigs进行物种注释；5）基于物种丰度矩阵对样本多样性进行统计分析；6）基于物种丰度矩阵对样本组间差异显著物种进行统计分析；7）对优化后的contigs进行分箱；8）对分箱得到的bins进行基因注释；9）基于基因丰度矩阵对样本组间差异显著基因进行统计分析；10）基于基因注释结果，完成功能注释以及物种注释；本发明提供了从三代宏基因组测序数据处理到物种组成分析、基因组成分析与功能注释的分析方法，解决了宏基因组数据自动化精准分析难题。

著录项

  • 公开/公告号CN112133368A

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2020-12-25

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 南开大学;

    申请/专利号CN202011090802.8

  • 发明设计人 刘健;田妹;陈娇;

    申请日2020-10-13

  • 分类号G16B20/30(20190101);G16B30/10(20190101);G16B40/00(20190101);G16B45/00(20190101);

  • 代理机构11427 北京科家知识产权代理事务所(普通合伙);

  • 代理人徐思波

  • 地址 300110 天津市南开区卫津路94号

  • 入库时间 2023-06-19 09:19:57

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