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一种基于句嵌入Infersent模型的蛋白质-蛋白质相互作用预测方法

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摘要

本发明公开了一种基于句嵌入Infersent的模型预测蛋白质‑蛋白质相互作用的方法，其是基于自然语言处理模型Infersent结合基因本体去预测蛋白质‑蛋白质相互作用(Protein‑Protein Interaction，简称PPI)。该方法包括结合GO图结构，得到GO术语词向量；对基因本体论注释(GOA)文件进行筛选提取，生成GO注释公理；在基于句嵌入Infersent的模型上结合GO注释公理与GO术语词向量去训练PPI阳性阴性数据集，最终得到预测PPI的模型。本发明针对现阶段预测PPI准确率与AUC不够高的问题，提出了一种新的预测PPI的方法，提高了预测准确率与AUC。

著录项

公开/公告号CN112185457A

专利类型发明专利
公开/公告日2021-01-05

原文格式PDF
申请/专利权人上海海事大学;
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申请/专利号CN202011085576.4
发明设计人江莹莹;李美晶;
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申请日2020-10-12
分类号G16B5/00(20190101);G16B30/00(20190101);G16B40/00(20190101);G06N3/04(20060101);G06N3/08(20060101);
代理机构31332 上海互顺专利代理事务所(普通合伙);
代理人成秋丽
地址 201306 上海市浦东新区临港新城海港大道1550号
入库时间 2023-06-19 09:27:35

法律信息

法律状态公告日

法律状态信息

法律状态
2023-03-10

发明专利申请公布后的撤回 IPC(主分类):G16B 5/00 专利申请号:2020110855764 申请公布日:20210105

发明专利申请公布后的撤回

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1. 一种基于句嵌入Infersent模型的蛋白质-蛋白质相互作用预测方法 [P] . 中国专利： CN112185457A . 2021-01-05
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