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一种环状RNA-RNA结合蛋白关系预测模型构建方法

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摘要

本发明公开了一种环状RNA‑RNA结合蛋白关系预测模型构建方法，解决了现有技术仅限制了预测准确率的问题，其技术方案要点是将初始的环状RNA序列数据集样本构造为环状RNA‑RNA结合蛋白序列对的形式；采用自监督学习的方式训练得到词向量字典；根据训练得到的词向量字典，将样本序列对映射成对应的词向量矩阵作为表征；将样本序列对的向量表征对应输入伪孪生网络，得到编码后的特征向量输入到度量函数中，计算绑定概率预测值并计算获得其与标签的差值，优化模型参数；模型训练迭代结束后保存得到的模型，本发明的环状RNA‑RNA结合蛋白关系预测模型构建方法，能针对RNA序列和蛋白质序列进行数据挖掘，能有效提高环状RNA‑RNA结合蛋白结合预测的准确率。

著录项

  • 公开/公告号CN112562788A

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2021-03-26

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 上海交通大学;

    申请/专利号CN202011575605.5

  • 发明设计人 袁亮亮;杨旸;

    申请日2020-12-28

  • 分类号G16B30/00(20190101);G16B50/30(20190101);G16B20/00(20190101);G06Q10/04(20120101);G06N3/08(20060101);G06F40/289(20200101);G06F40/242(20200101);

  • 代理机构31227 上海伯瑞杰知识产权代理有限公司;

  • 代理人孟旭彤

  • 地址 200240 上海市闵行区东川路800号

  • 入库时间 2023-06-19 10:24:22

法律信息

  • 法律状态公告日

    法律状态信息

    法律状态

  • 2022-06-28

    授权

    发明专利权授予

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