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宏基因组病原微生物基因组数据库及其构建方法

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本发明涉及宏基因组技术领域，特别是涉及宏基因组病原微生物基因组数据库及其构建方法，该方法包含数据获取、基因组过滤、基因组分类、基因组去冗余等步骤，即得病原微生物基因组数据库。该数据库的构建方案和目前市场上存在的方案存在较大差异，首先在保证物种的丰富度的前提下，去除污染序列，低重复序列；并且挑选了物种具有代表性的质量高的Assembly序列作为参考基因组，将剩余基因组进行重新分类，剔除了分类错误的序列。然后在参考基因组的基础上对剩余基因组进行去冗余，保留了各个物种的特异性序列。这样即保留了物种基因组的丰富度，又保证了基因组的准确性。

著录项

公开/公告号CN114974411A

专利类型发明专利
公开/公告日2022-08-30

原文格式PDF
申请/专利权人杭州杰毅医学检验实验室有限公司;
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申请/专利号CN202210738515.6
发明设计人丁文超;刘紫丹;周逸文;王江浩;王珺;
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申请日2022-06-28
分类号G16B20/00;G16B30/00;G16B50/30;
代理机构浙江千克知识产权代理有限公司;
代理人黎双华
地址 311112 浙江省杭州市余杭区良渚街道金昌路2073号3号楼103室、103-1室
入库时间 2023-06-19 16:36:32

法律信息

法律状态公告日

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法律状态
2022-09-16

实质审查的生效 IPC(主分类):G16B20/00 专利申请号:2022107385156 申请日:20220628

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