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一种构象空间动态步长搜索方法

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摘要

一种构象空间动态步长搜索方法，包括以下步骤：对构象空间按照能量和温度分层，在每一层中再细分得到“构象室”，完成构象空间的初始化；随机扰动氨基酸序列得到一个初始构象，通过Rosetta Score3计算得到其能量值，存入相应能量层的构象室中；对所分能量层分配权重，在不同能量层赋予不同的片段组装步长和Monte Carlo扰动步长，同时设置温度参数列表，完成系统参数初始化；按权重依次随机选中能量层、构象室、构象，进行构象扩展，按照相应的Metropolis准则来判断是否接收当前构象，完成构象系综更新；迭代的进行上一步骤，直至到达设置的迭代次数。本发明提供了一种有效的构象空间增强采样方法。

著录项

  • 公开/公告号CN104200132B

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2017-04-19

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 浙江工业大学;

    申请/专利号CN201410362507.1

  • 发明设计人 张贵军;郝小虎;秦传庆;周晓根;程正华;陈铭;明洁;

    申请日2014-07-28

  • 分类号

  • 代理机构杭州斯可睿专利事务所有限公司;

  • 代理人王利强

  • 地址 310014 浙江省杭州市下城区朝晖六区潮王路18号

  • 入库时间 2022-08-23 09:55:30

法律信息

  • 法律状态公告日

    法律状态信息

    法律状态

  • 2017-04-19

    授权

    授权

  • 2015-01-07

    实质审查的生效 IPC(主分类):G06F 19/16 申请日:20140728

    实质审查的生效

  • 2014-12-10

    公开

    公开

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