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基于循环神经网络预测多肽与HLA I型分子之间结合关系与结合亲和力的方法

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本发明公开了一种基于循环神经网络预测多肽与HLA I型分子之间结合关系与结合亲和力的方法，包括：构建两个训练集，其中，训练集1包括多个由多肽‑HLA I型序列及其亲和力组成的训练样本；训练集2包括多个由多肽‑HLA I型序列及其结合关系组成的训练样本；以双向GRU或带有注意力机制的双向GRU为基础，再加一个Sigmoid函数作为输出层组成预测网络，利用训练集1和训练集2训练预测网络，获得回归模型和分类模型；将待预测的多肽‑HLA I型序列输入至回归模型和分类模型，经计算获得多肽与HLA I型之间的预测亲和力数值。该方法能够快速较准确地预测多肽与HLA I型分子之间结合亲和力或结合关系。

著录项

公开/公告号CN109671469B

专利类型发明专利
公开/公告日2020-08-18

原文格式PDF
申请/专利权人浙江大学;
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申请/专利号CN201811511026.7
发明设计人周展;吴静成;赵文艺;周斌彬;陈枢青;
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申请日2018-12-11
分类号
代理机构杭州天勤知识产权代理有限公司;
代理人曹兆霞
地址 310013 浙江省杭州市西湖区余杭塘路866号
入库时间 2022-08-23 11:09:55

法律信息

法律状态公告日

法律状态信息

法律状态
2020-08-18

授权

授权
2019-05-17

实质审查的生效 IPC(主分类):G16B40/20 申请日:20181211

实质审查的生效
2019-04-23

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