首页> 中国专利> 一种获取ADAR蛋白细胞内高效结合的底物序列的方法及底物序列和应用

一种获取ADAR蛋白细胞内高效结合的底物序列的方法及底物序列和应用

页面导航

摘要
著录项
相似文献

摘要

本发明公开了一种获取ADAR蛋白细胞内高效结合的底物序列的方法及底物序列和应用。所述方法包括如下步骤：S1.细胞准备及蛋白与RNA交联反应；S2.免疫共沉淀及双链RNA消化，连接，和逆转录；S3.cDNA环化、建库和高通量测序；S4.ADAR底物拼装；S5.高效结合底物的评估。本发明首次开发了一种获取ADAR蛋白细胞内高效结合的底物序列的方法irCLASH，本发明从实验及生物信息学的角度填补现有ADAR1结合底物研究存在的空缺，与现有其他研究蛋白与RNA相互作用的方法相比，可显著提高嵌合体读长的得率，可最大限度提高了ADAR蛋白作用底物的构建数量，同时缩短实验耗时、简化了实验操作。

著录项

公开/公告号CN111593093B

专利类型发明专利
公开/公告日2022-03-04

原文格式PDF
申请/专利权人中山大学;
展开▼

申请/专利号CN202010158889.1
发明设计人张锐;杨文兵;宋玉龙;
展开▼

申请日2020-03-09
分类号C12Q1/6809(20180101);
代理机构44102 广州粤高专利商标代理有限公司;
代理人赵崇杨
地址 510275 广东省广州市海珠区新港西路135号
入库时间 2022-08-23 13:12:16

相似文献

专利
中文文献
外文文献

1. 一种获取ADAR蛋白细胞内高效结合的底物序列的方法及底物序列和应用 [P] . 中国专利： CN111593093B . 2022.03.04
2. 一种获取ADAR蛋白细胞内高效结合的底物序列的方法及底物序列和应用 [P] . 中国专利： CN111593093A . 2020-08-28
3. Processes for preparing sequences, to synthesize and to select different sequences.And to identify at least one sequence and apparatus for the preparation of various polymers and a substrate for selecting polymers for selection of activity biologica.To form the various sequences and to deteccao of regions marked and substrate for selection of activity biologica [P] . BR9007425A . 1992-07-21

机译：制备序列，合成和选择不同序列的方法，以及鉴定至少一种用于制备各种聚合物的序列和装置以及用于选择用于选择生物活性的聚合物的底物，以形成各种序列并检测区域标记和底物用于选择生物活性
4. Probe binding substrate, method of manufacturing the probe binding substrate, probe array, the method for detecting a target substance, a method of identifying the nucleotide sequence of a single stranded nucleic acid in a sample, and a method of quantifying a target substance in a sample [P] . 日本专利： JP4261661B2 . 2009-04-30

机译：探针结合底物，探针结合底物的制造方法，探针阵列，检测靶标物质的方法，鉴定样品中单链核酸的核苷酸序列的方法以及对样品中靶标物质进行定量的方法样品
5. DNA SEQUENCE CODING RIP-ASSOCIATED PROTEIN (RAP-2), RAP-2 binding protein, its isoform, fragment or analog, method of isolating and identifying proteins comprising RAP-2 binding properties as well as application of one or more RAP-2 binding proteins [P] . PL199214B1 . 2008-08-29

机译： DNA序列编码RIP结合蛋白（RAP-2），RAP-2结合蛋白，其同工型，片段或类似物，分离和鉴定包含RAP-2结合特性的蛋白的方法以及一种或多种RAP-2结合的应用蛋白质