QTL

摘要： 挖掘新的控制水稻抽穗期相关位点和候选基因,对抽穗期的遗传机制研究和品种改良具有重要的意义。利用抽穗期存在明显差异的粳稻TD70和籼稻Kasalath杂交衍生的包含186个家系的重组自交系群体,构建了基于深度重测序的高密度Bin遗传图谱,图谱共包含12,328个Bin标记。RIL群体及亲本2018年和2021年正季种植于江苏省南京市江苏省农业科学院。以家系从播种到抽穗所经历的天数作为抽穗期表型值,使用IciMapping软件3.4版的完备区间作图法,对控制水稻抽穗期的QTL进行鉴定。2年共检测到15个抽穗期的QTL,分布在3号、6号、7号、8号、10号和12号染色体上,LOD值为2.58~10.68,其中7个QTL和已知抽穗期QTL的位置存在重叠或者部分重叠。共有4个QTL在2年均检测到,表现出较强的稳定性。对2年重复鉴定到的4个QTL区间进行基因功能注释和亲本间序列分析,共发现7个注释有功能,且在2个亲本间编码区存在非同义突变的基因。根据候选基因SNP的类型对RIL群体家系进行基因等位型分类和效应分析,发现4个基因其不同等位型的RIL家系在抽穗期上存在显著或者极显著差异,推测可能为候选基因,可用于后续水稻抽穗期的分子机制研究。

摘要： [目的]基于水稻MAGIC-Hei(Multi-parent advanced generation inter-cross)群体,在多环境下挖掘镉含量相关新位点/基因,并筛选含有低镉等位基因的优良株系,为选育低镉积累品种提供新的基因和种质资源.[方法]将由8个亲本衍生的MAGIC群体分别于2017、2018、2019和2020年度种植于湖南长沙并开展稻米镉含量表型测试分析.利用GBS(genotyping by sequencing)简化基因组测序获得基因型数据,对稻米镉含量开展全基因组关联分析(genome-wide association analysis,GWAS),发掘QTL位点,解析其遗传机制.[结果]检测到了14个镉积累相关的QTL位点,除了第8染色体之外,其他11条染色体上均有分布.其中6个位点与已报道基因一致,8个为新发现位点.另外,这8个位点分布在第2、4、7、9和12染色体上,均可以在两个及以上环境中检测到,效应较为稳定,可用于下一步精细定位及功能研究.结合基因注释和基因表达分析结果,推测LOC_Os02g37160、LOC_Os02g49560、LOC_Os04g39010和LOC_Os06g46310为镉含量相关位点候选基因,这些基因与重金属转运和积累等功能相关.另外,我们筛选到10个携带有利等位基因的优良株系,可用于低镉积累水稻材料的创制.[结论]发掘了8个水稻镉积累相关性状的QTL位点和低镉优异材料,对于镉积累相关遗传研究和利用分子标记辅助选育低镉积累品种具有一定意义.

摘要： 分枝角度是油菜重要株型性状。为筛选和发现适度紧凑的分枝角度调控基因,以提高产量利于机械化收获,以分枝角度差异显著的油菜品种Holly和APL01为亲本构建的重组自交系(RIL)群体为材料,在2个环境中对分枝角度进行QTL定位及候选基因分析。结果表明,RIL群体分枝角度表现出连续变异且呈正态分布。利用前期构建的高密度SNP遗传连锁图谱,结合2环境中分枝角度表型数据进行QTL定位分析,共定位到8个分枝角度QTL,分别位于A9、C3、C4和C7染色体上,单个QTL可解释的表型变异范围为4.05%~9.60%。与前人研究结果比较,本研究定位了2个新的稳定表达的QTL,cqBA.C4-2和cqBA.C4-3,分别在2个环境中解释表型变异的5.13%~6.80%和4.60%~7.21%。根据Holly和APL01的重测序结果,在cqBA.C4-2置信区间(10.32~14.3 Mb)内共发现7226个SNP和829个InDel,其中7226个SNP中包含220个非同义突变和5个stopgain突变,829个InDel中有15个造成移码突变,这些突变位点共对应55个基因;在cqBA.C4-3置信区间(44.39~44.46 Mb)内共发现416个SNP和65个InDel,其中416个SNP中包含50个非同义突变,65个InDel中有1个造成移码突变,这些突变位点共对应15个基因。根据拟南芥同源基因的功能注释,共筛选到4个分枝角度相关的候选基因,BnaC04g13100D、BnaC04g15900D、BnaC04g16280D和BnaC04g44330D,期待为揭示油菜分枝角度的调控机制,通过分子设计方法培育株型紧凑的油菜品种提供参考。

摘要： Plant height is an important agronomic trait, which is governed by multiple genes with major or minor effects. Of numerous QTLs for plant height reported in soybean, most are in large genomic regions, which results in a still unknown molecular mechanism for plant height. Increasing the density of molecular markers in genetic maps will significantly improve the efficiency and accuracy of QTL mapping. This study constructed a high-density genetic map using 4 011 recombination bin markers developed from whole genome re-sequencing of 241 recombinant inbred lines(RILs) and their bi-parents, Zhonghuang 13(ZH) and Zhongpin 03-5373(ZP). The total genetic distance of this bin map was 3 139.15 cM,with an average interval of 0.78 cM between adjacent bin markers. Comparative genomic analysis indicated that this genetic map showed a high collinearity with the soybean reference genome. Based on this bin map, nine QTLs for plant height were detected across six environments, including three novel loci(qPH-b_11, qPH-b_17 and qPH-b_18). Of them, two environmentally stable QTLs qPH-b_13 and qPH-b_19-1 played a major role in plant height, which explained 10.56-32.7% of the phenotypic variance. They were fine-mapped to 440.12 and 237.06 kb region, covering 54 and 28 annotated genes, respectively. Via the function of homologous genes in Arabidopsis and expression analysis, two genes of them were preferentially predicted as candidate genes for further study.

摘要： 【目的】挖掘新的控制水稻叶绿素含量的相关位点和基因,为水稻叶绿素含量的遗传机制研究提供理论基础。【方法】利用剑叶叶色存在明显差异的粳稻TD70和籼稻Kasalath杂交构建的包含186个株系的重组自交系群体为供试材料,通过对两亲本及RIL群体重测序,构建了包含12328个Bin标记的高密度遗传图谱。RIL群体及亲本分别于2011和2020年正季在江苏省农业科学院种植。抽穗后第3天使用叶绿素仪测定剑叶SPAD值。使用IciMappingv3.4软件完备区间作图法,对控制水稻抽穗期剑叶叶绿素含量的QTL进行鉴定。利用便携式光合仪测定RIL群体中20个SPAD极端株系的水分利用效率、蒸腾速率、气孔导度和净光合速率等光合作用参数。【结果】2年共检测到19个抽穗期剑叶叶绿素含量相关QTL,分别分布在除第8、9和10染色体外的其他9个染色体上。单一QTL贡献率为3.09%—13.13%,LOD值为2.74—14.08。通过物理位置比对,发现其中10个QTL与前人定位到的叶绿素含量相关位点在相同或邻近区域。qCHL2-1和qCHL5-12年均被检测到,表现出较强的稳定性。qCHL2-1位于第2染色体的7.63—7.71 Mb处,2年LOD值分别为14.08和7.93,贡献率分别为13.13%和7.94%。qCHL5-1位于第5染色体的23.44—23.49 Mb处,2年LOD值分别为4.31和3.76,贡献率分别为3.57%和4.82%。结合功能注释和亲本间序列分析,分别在qCHL2-1和qCHL5-1染色体区间内找到2个与剑叶叶绿素含量相关的基因Os02g0236000和Os05g0476700。这两个基因的核苷酸序列在两亲本间均存在差异。Os02g0236000编码水稻天冬氨酸氨基转移酶(AAT1),是水稻氮代谢途径中的重要酶,与蛋白质及氨基酸含量有关。Os05g0476700编码叶面斑点相关蛋白,推测与叶片颜色有关。根据AAT1在CDS+273 bp有无突变对RIL群体进行等位型分类。在20个SPAD极端株系中,AAT1不同等位型株系的剑叶SPAD值和水分利用效率、蒸腾速率、气孔导度和净光合速率等光合作用指标均存在显著差异。【结论】共检测到19个控制水稻抽穗期剑叶叶绿素含量QTL,鉴定了2个稳定存在的QTL——qCHL2-1和qCHL5-1,在这两个QTL区间筛选到2个可能调控水稻抽穗期剑叶叶绿素含量的基因。其中1个AAT1(Os02g0236000)不同等位型的光合作用参数在20个极端SPAD株系中存在显著差异,推测其为最可能的候选基因,可用于后续剑叶叶绿素调控基因的功能研究。

摘要： 籽粒大小是大豆产量和外观品质的重要构成要素,具有巨大的经济价值,一直以来都是育种的主要目标之一。大豆籽粒大小由胚、胚乳和种皮发育共同协调决定。目前已报道的与大豆籽粒重相关的QTL位点309个,但大多位点尚未进行功能验证。已发现的与大豆籽粒大小相关的基因有17个,多数与母本种皮发育调控相关,其它与合子组织和植物激素调控途径相关。其中,发挥正向和负向调控作用的基因分别有12个和4个。在不影响大豆品质情况下,PP2C-1、Gm20OX和CYP78A等基因在植物个体发育过程中对籽粒大小的调节发挥关键作用,有望成为大豆分子设计育种中的优良靶点。本文重点从连锁分析和关联分析方法,介绍了已鉴定的与大豆籽粒大小相关的QTL及其位点,综述了大豆籽粒大小调控分子机制的研究进展,并根据现阶段的研究探讨了未来的研究热点和研究方向,以期为大豆籽粒分子调控机制全面解析和高产育种技术创新提供理论参考。

摘要： 为分析玉米小斑病的遗传抗性,分别利用抗病自交系CIMBL29和感病自交系GEMS41为供体亲本和轮回亲本,通过2次回交和3次自交构建了含有179个家系的BC2F4群体。在2017年(河南长葛)和2018年(河南西平)两个环境条件下对群体小斑病抗性进行了评估,结合SNP分子标记构建的高密度遗传连锁图谱,对抗小斑病QTL进行鉴定。QTL定位结果表明,在2个环境中共鉴定了4个抗小斑病QTL,分布在第1、5、6和8染色体上。其中位于第1染色体和第6染色体上的QTL(qSLB1和qSLB6)在2个环境条件下均可以检测到,是稳定的抗病QTL位点,其中,在2017和2018年,qSLB1分别可以解释9.3%和10.9%的抗性表型变异;qSLB6分别可以解释6.3%和6.6%的表型变异。环境稳定型抗病QTL的鉴定为抗病基因精细定位和分子育种奠定了基础。

摘要： 粒重稳定性是小麦稳产性的重要评价指标。为了发掘小麦在遭受虫害等减源逆境伤害时影响粒重稳定性的QTL,以小偃81和西农1376杂交衍生的重组自交系(RILs)群体为试验材料,设早播和晚播两个播期,对减源处理下该群体的粒长、粒宽和千粒重进行表型分析,同时计算减源处理与对照处理的表型比值,进而估测发育稳定性,并利用50K芯片构建的遗传连锁图谱进行QTL定位。结果表明,与对照处理相比,减源处理下RIL群体的粒长、粒宽和千粒重均显著下降。采用完备复合区间模型对不同处理的表型值、表型比值分别进行QTL定位,共检测到18个QTL,分布于2A、3A、3B、3D、4B、4D和5D染色体上,其中有8个QTL在减源处理和对照处理中均表达,Qgl.nwafu-5D.3和Qkgw.nwafu-5D均在早播对照处理和晚播减源处理中被检测到,平均可解释表型变异的8.73%和8.19%,为稳定QTL,且Qgl.nwafu-5D.3也在早播减源处理中被检测到,推测这2个稳定QTL可能为新发现的位点。控制表型比值的QTL大多与控制粒长、粒宽和千粒重的QTL区间重合,推测维持减源后粒重稳定性的QTL与控制粒长、粒宽和千粒重的位点紧密连锁或存在“一因多效”现象。

摘要： 研究采用芽期耐盐性状差异显著的东农46和L-100杂交衍生的包含127个家系的F2:12和F2:13重组自交系群体为试验材料,调查耐盐性状:吸胀率(IR)、发芽指数(GI)和发芽率(GR),计算3个相对耐盐指数:相对吸胀率(STIR)、相对发芽指数(STGI)和相对发芽率(STGR),利用QTL IciMapping 4.1.0.0软件对3个相对耐盐指数作QTL分析。结果表明,共检测到12个加性QTL,贡献率为4.88%~15.91%,2个位点有重叠区间,3个性状表型贡献率最高QTL分别为qSTIR-9-1(15.91%)、qSTGI-2-1(10.21%)和qSTGR-20-1(12.23%),共检测到108个上位性QTL,贡献率为0.55%~26.59%。该耐盐性状QTL为分子辅助培育抗盐大豆品种奠定基础。

摘要： 利用高产广适亲本扬麦158和抗纹枯病种质资源CI12633构建的重组自交系(RIL)群体为研究对象,采用ddRAD-seq技术开发SNP标记并构建遗传连锁图,结合RIL群体2018—2020年的千粒重表型数据进行千粒重相关QTL的定位。结果表明:RIL群体的千粒重存在超双亲分离,且基本符合正态分布,RIL群体家系间及年度间的差异均达极显著水平;2018—2020年共检测到5个QTL位点,分别位于1A、4A、6A、6B和7D染色体,单个QTL可解释9.70%~21.80%的表型变异,其中位于4A和6B染色体的2个QTL位点可在不同年份重复检测到,可能为主效QTL,可用于分子标记辅助选择育种。

摘要： 初情期是指雌性动物第一次表现发情的时间。初情是雌性动物发育过程中一个关键的阶段,目前有关初情期的遗传机制知之甚少。本研究以白色杜洛克×二花脸资源家系F2群体为研究材料,利用覆盖猪19条染色体的183个微卫星标记,对454有初情期详细表型记录的F2个体进行全基因组扫描,采用复合线性回归区间定位的方法定位影响猪初情期的QTL。共检测到4个影响猪初情期的QTL,分别位于1、7、8和17号染色体上,分别解释4.668﹪、8.480﹪、2.529﹪和2.292﹪的表型变异,其中1和7号染色体上的QTL达到基因组显著水平,另2个达到染色体显著水平。

摘要： 初情期是指雌性动物第一次表现发情的时间。初情是雌性动物发育过程中一个关键的阶段,目前有关初情期的遗传机制知之甚少。本研究以白色杜洛克×二花脸资源家系F2群体为研究材料,利用覆盖猪19条染色体的183个微卫星标记,对454有初情期详细表型记录的F2个体进行全基因组扫描,采用复合线性回归区间定位的方法定位影响猪初情期的QTL。共检测到4个影响猪初情期的QTL,分别位于1、7、8和17号染色体上,分别解释4.668﹪、8.480﹪、2.529﹪和2.292﹪的表型变异,其中1和7号染色体上的QTL达到基因组显著水平,另2个达到染色体显著水平。

摘要： 以自育高品质中长绒棉品种(新陆中9号提高系)9-1696,与主栽品种中棉所35,配置单交组合及其衍生世代,筛选出13对SSR引物在F群体(180株)和B群体(135株)进行纤维长度、整齐度、比强度和伸长率四个纤维品质性状的QTL分析,采用区间作图法(LOD>2.0),在F群体中检测到6个与纤维品质性状连锁的QTL位点。其中,检测到纤维长度、纤维整齐度、伸长率各1个QTL位点,比强度检测到3个QTL;在B群体中检测到2个QTL,分别与比强度和纤维长度连锁。

摘要： 以自育高品质中长绒棉品种(新陆中9号提高系)9-1696,与主栽品种中棉所35,配置单交组合及其衍生世代,筛选出13对SSR引物在F群体(180株)和B群体(135株)进行纤维长度、整齐度、比强度和伸长率四个纤维品质性状的QTL分析,采用区间作图法(LOD>2.0),在F群体中检测到6个与纤维品质性状连锁的QTL位点。其中,检测到纤维长度、纤维整齐度、伸长率各1个QTL位点,比强度检测到3个QTL;在B群体中检测到2个QTL,分别与比强度和纤维长度连锁。

摘要： 以自育高品质中长绒棉品种(新陆中9号提高系)9-1696,与主栽品种中棉所35,配置单交组合及其衍生世代,筛选出13对SSR引物在F群体(180株)和B群体(135株)进行纤维长度、整齐度、比强度和伸长率四个纤维品质性状的QTL分析,采用区间作图法(LOD>2.0),在F群体中检测到6个与纤维品质性状连锁的QTL位点。其中,检测到纤维长度、纤维整齐度、伸长率各1个QTL位点,比强度检测到3个QTL;在B群体中检测到2个QTL,分别与比强度和纤维长度连锁。

摘要： 以自育高品质中长绒棉品种(新陆中9号提高系)9-1696,与主栽品种中棉所35,配置单交组合及其衍生世代,筛选出13对SSR引物在F群体(180株)和B群体(135株)进行纤维长度、整齐度、比强度和伸长率四个纤维品质性状的QTL分析,采用区间作图法(LOD>2.0),在F群体中检测到6个与纤维品质性状连锁的QTL位点。其中,检测到纤维长度、纤维整齐度、伸长率各1个QTL位点,比强度检测到3个QTL;在B群体中检测到2个QTL,分别与比强度和纤维长度连锁。

摘要： 繁殖性状是养猪生产中重要经济性状之一,其遗传力一般较低,采用传统的数量遗传学选择方法进行选择收效甚微.目前的选择方法主要有直接选择排卵率和产仔数、通过胎盘效率选择提高产仔数和根据控制猪窝产仔数的主效基因进行选择.基因组扫描和候选基因法是发现主效基因的主要方法.利用不同的资源家系,采用基因组扫描发现控制排卵率的QTL位于猪4号染色体(Sus scrofa chromosome 4,SSC4)、 SSC8、SSC13、SSC15;控制处情期日龄位于SSC1、SSC7、SSC8、SSC10、V12;控制猪黄体数位于SSC3、SSC7、SSC8、SSC9、SSC10和SSC15;控制窝产仔数位于SSC6、SSC11;产活仔猪数位于SSC11;流产仔猪数在SSC5和SSC13等.与猪繁殖性状相关的候选基因有ESR(雌激素受体)、 FSHβ(促卵泡素β亚基)、RARG(视黄酸受体?)和RBP4(视黄酸结合蛋白4)、PRLR(促乳素受体)、BMP15(骨形成蛋白15 )、 OPN(骨桥蛋白)基因等.随着人类和动物基因组计划的逐渐完成,以及人与猪比较基因组图谱的逐步建立和完善,将会有更多的QTL或候选基因被发现,并应用于猪的育种实践.

摘要： 繁殖性状是养猪生产中重要经济性状之一,其遗传力一般较低,采用传统的数量遗传学选择方法进行选择收效甚微.目前的选择方法主要有直接选择排卵率和产仔数、通过胎盘效率选择提高产仔数和根据控制猪窝产仔数的主效基因进行选择.基因组扫描和候选基因法是发现主效基因的主要方法.利用不同的资源家系,采用基因组扫描发现控制排卵率的QTL位于猪4号染色体(Sus scrofa chromosome 4,SSC4)、 SSC8、SSC13、SSC15;控制处情期日龄位于SSC1、SSC7、SSC8、SSC10、V12;控制猪黄体数位于SSC3、SSC7、SSC8、SSC9、SSC10和SSC15;控制窝产仔数位于SSC6、SSC11;产活仔猪数位于SSC11;流产仔猪数在SSC5和SSC13等.与猪繁殖性状相关的候选基因有ESR(雌激素受体)、 FSHβ(促卵泡素β亚基)、RARG(视黄酸受体?)和RBP4(视黄酸结合蛋白4)、PRLR(促乳素受体)、BMP15(骨形成蛋白15 )、 OPN(骨桥蛋白)基因等.随着人类和动物基因组计划的逐渐完成,以及人与猪比较基因组图谱的逐步建立和完善,将会有更多的QTL或候选基因被发现,并应用于猪的育种实践.

摘要： 繁殖性状是养猪生产中重要经济性状之一,其遗传力一般较低,采用传统的数量遗传学选择方法进行选择收效甚微.目前的选择方法主要有直接选择排卵率和产仔数、通过胎盘效率选择提高产仔数和根据控制猪窝产仔数的主效基因进行选择.基因组扫描和候选基因法是发现主效基因的主要方法.利用不同的资源家系,采用基因组扫描发现控制排卵率的QTL位于猪4号染色体(Sus scrofa chromosome 4,SSC4)、 SSC8、SSC13、SSC15;控制处情期日龄位于SSC1、SSC7、SSC8、SSC10、V12;控制猪黄体数位于SSC3、SSC7、SSC8、SSC9、SSC10和SSC15;控制窝产仔数位于SSC6、SSC11;产活仔猪数位于SSC11;流产仔猪数在SSC5和SSC13等.与猪繁殖性状相关的候选基因有ESR(雌激素受体)、 FSHβ(促卵泡素β亚基)、RARG(视黄酸受体?)和RBP4(视黄酸结合蛋白4)、PRLR(促乳素受体)、BMP15(骨形成蛋白15 )、 OPN(骨桥蛋白)基因等.随着人类和动物基因组计划的逐渐完成,以及人与猪比较基因组图谱的逐步建立和完善,将会有更多的QTL或候选基因被发现,并应用于猪的育种实践.

摘要： 繁殖性状是养猪生产中重要经济性状之一,其遗传力一般较低,采用传统的数量遗传学选择方法进行选择收效甚微.目前的选择方法主要有直接选择排卵率和产仔数、通过胎盘效率选择提高产仔数和根据控制猪窝产仔数的主效基因进行选择.基因组扫描和候选基因法是发现主效基因的主要方法.利用不同的资源家系,采用基因组扫描发现控制排卵率的QTL位于猪4号染色体(Sus scrofa chromosome 4,SSC4)、 SSC8、SSC13、SSC15;控制处情期日龄位于SSC1、SSC7、SSC8、SSC10、V12;控制猪黄体数位于SSC3、SSC7、SSC8、SSC9、SSC10和SSC15;控制窝产仔数位于SSC6、SSC11;产活仔猪数位于SSC11;流产仔猪数在SSC5和SSC13等.与猪繁殖性状相关的候选基因有ESR(雌激素受体)、 FSHβ(促卵泡素β亚基)、RARG(视黄酸受体?)和RBP4(视黄酸结合蛋白4)、PRLR(促乳素受体)、BMP15(骨形成蛋白15 )、 OPN(骨桥蛋白)基因等.随着人类和动物基因组计划的逐渐完成,以及人与猪比较基因组图谱的逐步建立和完善,将会有更多的QTL或候选基因被发现,并应用于猪的育种实践.

摘要： 本发明涉及分子生物学及遗传育种技术领域，具体涉及芝麻籽粒圆度主效QTL位点、与QTL位点紧密连锁的分子标记、分子标记引物、应用。本发明籽粒形状存在显著差异的芝麻品种豫芝4号和孟加拉小籽杂交，并以豫芝4号为父本进行回交，获得BC

摘要： 本发明公开了一种玉米抗茎腐病主效QTL、与主效QTL连锁的分子标记和应用。本发明提供的QTL，定位于第10号染色体上，位于分子标记SSR334和SSR58之间。本发明还提供了该主效QTL的59对分子标记。本发明提供的分子标记与茎腐病抗性在统计水平上显著相关，可以用于玉米抗茎腐病的分子标记辅助育种，产生抗性品种或改良玉米品种对茎腐病的抗性。

摘要： 本发明涉及分子生物学及遗传育种技术领域，具体涉及芝麻籽粒圆度主效QTL位点、与QTL位点紧密连锁的分子标记、分子标记引物、应用。本发明籽粒形状存在显著差异的芝麻品种豫芝4号和孟加拉小籽杂交，并以豫芝4号为父本进行回交，获得BC1群体在LG06连锁群定位了一个控制芝麻籽粒圆度的主效QTL位点，在不同环境中可解释表型变异的25.37%−39.36%，命名为qSR_LG06。并开发出与qSR_LG06紧密连锁的SSR分子标记及其引物，可以有效预测芝麻遗传分离材料籽粒为卵圆或长卵圆形，通过分子标记辅助选择，可以在低世代对育种材料籽粒形状进行快速、准确、高效地筛选。

摘要： 本发明公开了一种调控水稻剑叶叶片大小的多效QTLs，所述QTLs位点定位于水稻4号染色体DNA片段上，命名为qTLS‑4，遗传距离为87.1‑97.4cM，物理距离为28747360‑29507404bp，对水稻剑叶叶片大小具有调控作用。本发明还公开了调控水稻剑叶叶片大小的多效QTLs位点的qTLS‑4分子标记，包括紧密连锁的两对分子标记Indel Fls‑1和Indel Fls‑2。本发明利用分子标记方法来检测水稻品种或品系中是否具有调控水稻剑叶叶片大小的QTLs，从而加快水稻优异品种的选育进程。

摘要： 本发明公开了一种玉米抗茎腐病主效QTL、与主效QTL连锁的分子标记和应用。本发明提供的QTL，定位于第10号染色体上，位于分子标记SSR334和SSR58之间。本发明还提供了该主效QTL的59对分子标记。本发明提供的分子标记与茎腐病抗性在统计水平上显著相关，可以用于玉米抗茎腐病的分子标记辅助育种，产生抗性品种或改良玉米品种对茎腐病的抗性。

摘要： 本发明公开了一种与玉米抗南方锈病主效QTL紧密连锁的分子标记，所述玉米抗南方锈病主效QTL位点，是位于玉米第6号染色体上bin 6.01区域内的qSCR6.01，与其紧密连锁的分子标记包括2个InDel标记—SCR01和SCR02；InDel标记SCR01和SCR02的InDel物理位置分别为88159962和88561362。本发明中玉米抗南方锈病的主效QTL位点位置明确，贡献率较高，能显著改善玉米自交系材料的抗南方锈病性状，检测方法方便快速，不受环境影响，为玉米抗病分子育种提供了一条可行的技术途径。

摘要： 本发明公开了一种与绿豆抗枯萎病主效QTL位点Fov2‑1紧密连锁的分子标记及应用，属于绿豆分子育种技术领域。本发明以“潍绿9002‑341”和“V1128”形成F2:3分离群体为试验材料，利用SSR标记构建遗传连锁图谱，并结合绿豆抗枯萎病F2:3分离群体表型鉴定结果在遗传连锁图的第2连锁群检测到主效QTL位点Fov2‑1，与该主效QTL位点紧密连锁的SSR标记为Mchr4‑94和Mchr4‑32，标记之间的遗传距离为1.89cM，LOD为7.45，表型贡献率为61.01％，加性效应为‑21.28。本发明所获得的与绿豆抗枯萎病主效QTL位点Fov2‑1紧密连锁的分子标记可用于绿豆抗枯萎病早期选择，对于提高抗枯萎病绿豆的育种效率具有重要意义。

摘要： 本发明涉及调控玉米叶片衰老的主效QTL及其分子标记和应用，属于分子遗传育种领域。所述的主效位点Stg3和Stg7具有调控玉米叶片衰老的功能，分别位于玉米的第3号和第7号染色体上，与它们连锁的分子标记分别为M36、A‑3‑11和A‑7‑6、A‑7‑7。本发明所述分子标记在筛选和鉴定具有叶片衰老延缓特性的玉米资源以及精细定位QTL中的目标基因中具有重要的应用价值，为分子遗传育种中延长作物叶片光合作用功能期提供了重要的候选位点。

摘要： 本发明属于作物分子遗传育种技术领域，公开了一种与小麦抗条锈QTL连锁的KASP分子标记及应用，KASP分子标记的核苷酸序列包括第一核苷酸序列和第二核苷酸序列；所述第一核苷酸序列为SEQ ID NO：1，所述第二核苷酸序列为SEQ ID NO：2。本发明的位于小麦2A染色体上的与小麦抗条锈病连锁的分子标记是小麦2A染色体短臂上抗条锈病位点QYr.sicau‑2AS的侧翼标记，连锁度高。本发明提供的标记可用来检测小麦2A染色体上的抗条锈病位点QYr.sicau‑2AS，快速筛选具有该位点的植株，进而提高小麦抗病育种效率。

摘要： 本发明公开了一种与小麦苗期侧根数目主效QTL紧密连锁的分子标记、其检测引物及其应用。所述分子标记的核苷酸为序列表中SEQ ID NO：1所示的序列；所述检测引物的核苷酸为SEQ ID NO：2和SEQ ID NO：3所示的序列。本发明还包括一种辅助鉴定小麦苗期侧根数目性状的方法，根据所述分子标记的核苷酸序列设计引物，以被检测小麦基因组DNA为模板进行扩增，并判断扩增产物中是否存在该分子标记。本发明能够用来检测小麦品种（系）中是否含有增加侧根数目的QTL位点，能够用于小麦优良根系构型的育种选育。