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猪基因组选择网络平台介绍

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家畜育种在畜牧业发展过程中扮演着极具重要的作用,在现代育种中,随着基因芯片技术的成熟,大量的芯片得到开发并广泛应用,基于芯片技术的基因组选择技术越来越受到广泛关注.由于可以利用覆盖整个基因组的信息,基因组选择准确性相较于传统的育种方法要高,可以实现早期选种、准确预测,也可大大缩短世代间隔,加快了遗传进展.通常基因组选择实施中涉及芯片数据管理、芯片填充、育种值估计、反应变量计算、针对不同性状模型特异的基因组育种值估计等流程,繁琐而复杂.基于此,本研究以猪为例,开发了基因组选择网络平台系统,能够整合高密度SNP芯片信息,系谱信息、性能测定信息,使常规育种与分子育种无缝衔接,操作更加简单、方便.本软件可以通过导入群体的原始基因型信息，表型信息，系谱信息，以及中间需要的一些映射文件信息和参数卡文件，基于GBLUP方法实现基因组估计育种值的快速准确估计，使猪基因组选择的一体化流程更加简单易操作。本软件平台主要分数据处理、数据查询、基因组遗传评估、系统管理、权限管理五大板块。

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来源
《中国畜牧兽医学会信息技术分会2016年学术研讨会》|2016年|48-54|共7页
会议地点山东东营
作者
宋海亮; 唐邵青; 张金鑫; 李乐义; 肖炜; 张勤; 丁向东;
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作者单位

中国畜牧兽医学会信息技术分会;

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会议组织
正文语种
原文格式 PDF
中图分类 S828.2;TP311.52;
关键词
猪; 育种工作; 基因组选择; 网络平台系统; 软件设计;
入库时间 2022-08-17 10:13:02

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