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正红菇菌根际土壤细菌多样性

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本实验以正红菇(Russula griseocarnosa)菌根际土壤为研究对象,通过提取土壤微生物基因组DNA,以通用引物扩增细菌16S rRNA基因V6+V8区,将PCR产物进行变性梯度凝胶电泳(Denaturing Gradient Gel Electrophoresis),获得土壤微生物群落的DNA特征指纹图谱,并对图谱中的优势条带回收测序,通过Blast进行同源性比对并构建系统发育树,进而分析正红菇菌根际细菌群落组成及多样性.同源性比对结果表明,回收测序的15条DGGE条带分别归属于7个细菌类群:α-变形菌门(Alphaproteobacteria)、β-变形菌门(Betaproteobacteria)、γ-变形菌门(Gammaproteobacteria)、酸杆菌门(Acidobateria)浮霉菌门(Planctomycetes)、疣微菌门(Verrucomicrobia)及分类地位未知的不可培养细菌.在15条序列中有7条分别与变形细菌的α、β和γ-Proteobacteria相似,有5条与酸杆菌门相似,有3条分别与浮霉菌门、疣微菌门及分类地位未知的不可培养细菌相似.

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来源
《福建省科协第十四届学术年会分会暨2014年福建省食用菌学会学术年会》|2014年|66-72|共7页
会议地点福建武夷山
作者
Xiao Donglai; 肖冬来; Chen Lihua; 陈丽华; Chen Yuhang; 陈宇航; Yang Jing; 杨菁;
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作者单位

福建省科协;

福建省食用菌学会;

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会议组织
正文语种
原文格式 PDF
中图分类 S646.9:S606.1;
关键词
正红菇; 外生菌根; 根际土壤; 细菌多样性;

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