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第一章问题的引出
1.1神经退行性疾病与药物设计
1.1.1自由基氧化胁迫
1.1.2蛋白质的错误折叠、聚集
1.1.3药物设计
1.2铜离子与神经退行性疾病
1.3构建铜离子螯合蛋白质数据库的意义
第二章生物信息学基础
2.1基因组测序与核酸序列数据库
2.2蛋白质测序与氨基酸序列数据库、蛋白质结构数据库
2.3生物序列分析
2.3.1序列比对简介
2.3.2核酸序列的分析方法
2.3.3蛋白质二级结构预测
2.3.4蛋白质三维结构的预测
第三章计算机科学在本论文中的应用
3.1 MySQL(结构化查询语言)
3.2 HTML(超文本标注语言)
3.3 PHP(超文本预处理器)
3.4 APACHE(Web服务器)
第四章细胞内铜离子的转运体系
4.1铜离子的摄取(uptake)
4.1.1高亲和力的铜离子转运体系
4.1.2低亲和力的铜离子转运体系
4.2 Cu+在细胞内的运输
4.2.1 ATX1、HAH1与CCC2
4.2.2 COX17、hCOX17与SC01
4.2.3 LYS7、CCS与SOD
4.3细胞内Cu+的其它转运方式
4.4存在的问题
第五章DCCP数据库的构建
5.1数据的收集
5.1.1三级结构数据的搜集
5.1.2一级序列数据的搜集
5.2数据的整理
5.3可用信息的提取
5.4数据库信息输入
5.5前台界面的编写及其与后台数据库的连接
5.6数据库的对外服务
5.7数据库的更新
第六章数据分析
6.1蛋白质分类
6.2不同性质氨基酸含量分析
6.2.1疏水氨基酸和亲水氨基酸含量分析
6.2.2蛋白质疏水性(Hydrophobicity)的变化
6.2.3形成β折叠的倾向性分析
6.3蛋白质的二级结构预测结果及其评价
6.3.1方法
6.3.2结果处理
6.3.3二级结构预测结果及讨论
6.4铜离子螯合蛋白的进化的一点讨论
第七章结论
参考文献
在学期间发表的学术论文目录
致谢
