基于生物信息学方法分析EGLN1在肾透明细胞癌中的表达及意义

姚宇同; 刘岩; 戴露; 夏彬彬

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为探究egl-9家族缺氧诱导因子1(EGLN1)在肾透明细胞癌(ccRCC)中的表达情况及临床意义,基于TCGA数据库中ccRCC患者的基因表达数据分析EGLN1在ccRCC组织和正常肾组织中的差异表达情况,应用UALCAN平台分析ccRCC中EGLN1在不同角度下的表达差异.基于TCGA数据库中ccRCC的临床数据,对EGLN1高低表达组进行生存分析,对EGLN1表达量与总生存期的相关性进行Cox分析,同时对临床数据中EGLN1基因表达情况进行基因富集分析.通过STRING数据库检索了编码蛋白间可能的潜在相互作用,并构建了蛋白质互作网络将其表示出来.获取EGLN1相关蛋白,并通过GEPIA平台进行相关分析.分析TCGA数据库中样本表达数据可知,EGLN1在ccRCC中的表达高于正常肾组织.应用UALCAN平台分析发现,EGLN1的高表达与患者的年龄有一定的相关性.生存分析显示EGLN1高表达时,ccRCC患者预后较好.单因素及多因素Cox分析提示EGLN1的表达量是ccRCC患者生存期的独立风险因素.基因富集分析提示EGLN1基因的表达与肾细胞癌(RCC)、癌症途径、泛素介导蛋白水解途径、细胞凋亡通路等密切相关.结果显示,EGLN1可能成为评估ccRCC预后的分子标志.

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来源
《激光生物学报》 |2021年第2期|185-192|共8页
作者
姚宇同; 刘岩; 戴露; 夏彬彬;
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作者单位

锦州医科大学附属第一医院泌尿外科锦州 121000;

锦州医科大学附属第一医院泌尿外科锦州 121000;

锦州医科大学附属第一医院泌尿外科锦州 121000;

锦州医科大学附属第一医院泌尿外科锦州 121000;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类肾小管、肾小球疾病;
关键词
EGLN1; 肾透明细胞癌; 癌症基因组图谱; 生物信息学; Cox分析;

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