多位点序列分型技术在凝结芽孢杆菌菌株分类中的应用

冯海霞; 王金龙; 吕伟; 刘胜利; 马艳艳

首页> 中文期刊> 《中国饲料》 >多位点序列分型技术在凝结芽孢杆菌菌株分类中的应用

多位点序列分型技术在凝结芽孢杆菌菌株分类中的应用

开具论文收录证明 >>

期刊封面封底目录下载 >>

文献代查 >>

页面导航

摘要
著录项
相似文献
相关主题

摘要

本文通过16S rRNA基因和多位点序列分型(MLST)技术,对凝结芽孢杆菌不同菌株进行亲缘关系分析。试验选取国内具有代表性的15株凝结芽孢杆菌菌株,菌株纯化后提取基因组DNA,采用传统的16S rRNA基因分子鉴定和MLST技术相结合进行分析。其中MLST采用5个管家基因:adk、recF、sucC、rpoB和spoOA,结合参考凝结芽孢杆菌菌株DSM1的已知管家基因序列,用CE Design V1.04软件设计引物进行PCR扩增,测序结果剪接、串联后,做系统进化树分析。结果显示:16S rRNA基因显示所有菌株的基因序列相似性在99%以上,无法区分菌株间的差异性。而MLST结果显示,国内大部分凝结芽孢杆菌菌株G1-G9、E21和Y1、Y2为第一类别(Bootstrap值≥99),Y3、Y4、Y5三个菌株为第二类别(Bootstrap值≥99),参考菌株DSM1和国内凝结芽孢杆菌菌株差异较大为第三类别。

著录项

来源
《中国饲料》 |2022年第3期|39-42|共4页
作者
冯海霞; 王金龙; 吕伟; 刘胜利; 马艳艳;
展开▼
作者单位

青岛尚德生物技术有限公司;

山东青岛266111;

山东隆科特酶制剂有限公司;

山东临沂276400;

展开▼
原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类饲料添加剂;
关键词
凝结芽孢杆菌; 多位点序列分型(MLST); 管家基因; 亲缘关系;

相似文献

中文文献
外文文献
专利

1. 1型 CRISPR位点间区序列分析在嗜热链球菌菌株分型中的应用 [J] . 张璐璐 ,严兴 ,赵勇 . 微生物学杂志 . 2016,第006期
2. 多位点序列分型技术以及在乳酸菌分类鉴定中的应用 [J] . 徐海燕 ,张和平 . 中国乳品工业 . 2013,第008期
3. 亚洲副溶血弧菌临床菌株的基于碱基序列和肽链序列的多位点序列分型研究 [J] . 徐嘉良 ,杜小莉 ,刘俊含 . 军事医学 . 2016,第009期
4. 亚洲副溶血弧菌临床菌株的基于碱基序列和肽链序列的多位点序列分型研究 [J] . 徐嘉良1 ,杜小莉2 ,刘俊含3 . 军事医学 . 2016,第009期
5. 全球副溶血弧菌环境菌株的基于碱基序列和肽链序列的多位点序列分型 [J] . 徐嘉良 ,杜小莉 ,卢昕 . 食品科学 . 2015,第021期
6. 应用新一代测序仪基于单分子序列8位数水平的经典HLA位点超高分辨率分型技术 [C] . T.Shiina ,S.Suzuki ,Y.Ozaki . 中华骨髓库第四届年会 . 2013
7. 自然发酵食品中植物乳杆菌的多位点序列分型研究 [A] . 冯淑贞 . 2016

多位点序列分型技术在凝结芽孢杆菌菌株分类中的应用

摘要

著录项

相似文献

相关主题

期刊订阅