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猪圆环病毒2型感染PK-15细胞差异表达miRNA和mRNA互作网络

         

摘要

旨在筛选猪圆环病毒2型感染猪肾上皮细胞(PK-15)后差异表达miRNA和mRNA,并探究miRNA和mRNA之间的互作关系.使用茎环定量PCR检测多个热点miRNA在PCV2感染组和未接种病毒组之间的差异表达水平以发现差异表达miRNA,分析PCV2感染后第12小时的蛋白质组学研究结果(GEO登录号:GSE71945)以获得差异表达mRNA,并分析差异表达miRNA和mRNA之间的互相作用关系.结果显示,在PCV2感染后第12小时miR-10b、miR-128、miR-155-5p、miR-21、miR-29b、miR-361-3p等表达量显著性变化,使用miRecords预测其靶基因,分别发现7 105、9 741、7 451、7 183、7 971、8 793个靶基因;PCV2感染后第12小时共有158个差异表达mRNA,分属于多种细胞结构成分并参与多条重要的细胞生物途径,且差异miRNA的靶基因和差异mRNA之间有大量的交集基因.上述结果表明,PCV2感染能导致细胞内多种miRNA差异表达,造成miRNA的靶基因表达紊乱,进而影响细胞正常的生命进程.

著录项

  • 来源
    《畜牧兽医学报》 |2019年第1期|115-125|共11页
  • 作者

    李畅; 李静; 何启盖;

  • 作者单位

    华中农业大学农业微生物学国家重点实验室;

    武汉430070;

    华中农业大学动物医学院;

    武汉430070;

    华中农业大学农业微生物学国家重点实验室;

    武汉430070;

    华中农业大学动物医学院;

    武汉430070;

    华中农业大学农业微生物学国家重点实验室;

    武汉430070;

    华中农业大学动物医学院;

    武汉430070;

  • 原文格式 PDF
  • 正文语种 chi
  • 中图分类 S852.659.2;
  • 关键词

    猪圆环病毒2型; PK-15细胞; miRNA; mRNA; 互作关系;

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