手足口病患儿柯萨奇病毒A4的鉴定及其5′UTR-VP4-VP2区序列分析

吉彦莉; 王永全

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目的分析2009年北京市西城区手足口病患儿柯萨奇病毒A4(CoxA4)5′UTR-VP4-VP2区进化特征,探讨其与国内外其他地区CoxA4分离株的关系。方法提取病毒RNA,进行半巢式RT-PCR扩增肠道病毒(EV)5′UTR-VP4-VP2区。通过测序和Blast比对确定EV型别;并对其进行序列和进化分析。结果共鉴定出两株CoxA4,Genbank登录号为JQ429434和JQ429435。进化分析表明,CoxA4包括3个进化树分支:原型株AY421762位于独立的分支,其余CoxA4构成两个基因型(Ⅰ型和Ⅱ型),每个基因型包括两个亚型(A和B)。在5′UTR-VP4-VP2区,两株CoxA4核苷酸序列同源性为96.00%;它们与原型株、基因Ⅰ型及Ⅱ型毒株序列同源性分别为87.00%～88.00%,85.00%～87.00%,92.00%～98.00%。两株CoxA4与其他中国株均位于基因Ⅱ型分支上。结论北京市西城区CoxA4株与我国近年CoxA4流行株在5′UTR-VP4-VP2区具有较高的同源性,且进化关系密切。

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来源
《中国预防医学杂志》 |2012年第9期|675-678|共4页
作者
吉彦莉; 王永全;
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作者单位

北京市西城区疾病预防控制中心;

北京100120;

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正文语种 chi
中图分类小儿传染病;
关键词
手足口病; 柯萨奇病毒A4型; 进化分析;

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