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陕西省9株乙脑病毒的分离及E基因序列分析

         
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分析陕西省分离的9株乙脑病毒基因组序列特征。使用乙脑病毒全基因组序列测定引物进行RT-PCR扩增，扩增产物进行测序，拼接后获得基因组序列。利用MEGA 4.1、MegAlin、MEGA7.0等软件进行毒株的系统进化分析，并与P3株、减毒活疫苗SA14-14-2株及覆盖5个基因型别的其他乙脑病毒进行E基因序列比对。9株分离株3株分离自猪舍、6株分离自羊舍，其中4株获得全基因组序列，5株测得E基因序列。基于E基因序列进行毒株核苷酸、氨基酸同源性比较，结果显示分离株均与基因I型GI-b亚型毒株核苷酸和氨基酸同源性最高，核苷酸同源性范围为96.5%～99.7%、氨基酸同源性范围99.2%～100.0%；与SA14-14-2株核苷酸同源性范围为87.5%～88.9%、氨基酸同源性范围96.3%～97.2%；与P3株核苷酸同源性范围为87.6%～88.1%、氨基酸同源性范围96.7%～97.6%。分析09年（陕南地区）分离株与18年（关中地区）分离株的E基因核苷酸差异率为1.8%～2.9%、氨基酸差异率为0%～0.8%。陕西省自然界中循环的乙脑病毒以基因Ⅰ型为主，与P3株在抗原毒力关键位点无差异，病毒相对保守。病毒分子生物学特征及分离生境提示我省需注意多种类乙脑传播媒介和宿主的防控。

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