星虫动物线粒体基因组全序列的基因排列和特征比较

申欣

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综合利用通用引物PCR和长PCR扩增,获得可口革囊星虫的线粒体DNA,结合鸟枪法和引物步移法获得可口革囊星虫的线粒体基因组.比较可口革囊星虫与方格星虫线粒体基因组,所有的37个基因均在同一条链上编码.2个星虫动物线粒体基因组蛋白质编码基因的起始、终止密码子及氨基酸长度存在差异.2个星虫动物的线粒体基因组,存在6个保守的基因区块:(1) nad6-cob-P-S2-C-M,(2) I-K-nad3-F,(3) nad4L-nad4-L2,(4) nad1-W-atp6,(5) nad5-S1及(6) nad2-cox1.去除转运RNA而仅比较蛋白质编码基因和核糖体RNA,则2个星虫动物线粒体基因组主编码基因的基因排列完全一致,均为:cox1-cox2-atp8-cox3-nad6-cob-srRNA-1rRNA-nad3-nad4L-nad4-nad1-atp6-nad5-nad2.星虫动物、环节动物和螠虫动物线粒体基因组共有5个保守区块:(1) cox1-cox2-atp8,(2)nad4L-nad4,(3) srRNA-1rRNA,(4) cox3-nad6-cob,(5) atp6-nad5.在15个主编码基因中,nad5基因和nad4基因变异位点数最多,因此可作为备选的分子标记,用于分析星虫动物不同物种和群体之间的生物多样性.

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来源
《水产科学》 |2012年第9期|554-559|共6页
作者
申欣;
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作者单位

淮海工学院海洋学院,江苏连云港222005;

中国科学院海洋研究所,山东青岛266071;

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正文语种 chi
中图分类星虫纲;
关键词
星虫动物; 线粒体基因组; 基因排列; 分子标记;

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