首页> 中文期刊> 《淡水渔业》 >DNA条形码在西藏水系裂腹鱼亚科鱼类鉴定中的研究

DNA条形码在西藏水系裂腹鱼亚科鱼类鉴定中的研究

         

摘要

为确定DNA条形码技术在西藏水系裂腹鱼亚科(Schizothoracinae)物种鉴定中的可行性,利用西藏水系所采集260尾裂腹鱼亚科样本,测定其线粒体细胞色素C氧化酶亚基1(COI)基因片段序列,计算遗传距离,构建系统发育树,并与GenBank中相关序列进行比对.260个样本经检测均获得有效COI基因扩增片段,COI基因碱基组成偏倚明显,A+T含量为54.74%,显著高于G+C含量(45.26%).基于Kimura双参数模型计算遗传距离,遗传距离阈值设置为0.02时,260个样本可被鉴定到种的为249尾样本,11尾由于样本量少,数据库中存在多个命名,只鉴定到属,其中与形态学鉴定一致的179尾样本,一致率为68.8%,裂腹鱼亚科裸鲤属(Gymno-cypris)不能通过COI基因鉴定到种,拉萨裂腹鱼(Schizothoracinae)、 异齿裂腹鱼(S.schizothorax o'connori)、 巨须裂腹鱼(S.macropogon)3个种之间的遗传距离阈值以0.02不能有效鉴别,而遗传距离阈值以0.01作为这3个种的鉴定标准,可达到有效鉴别的目的.基于邻接法构建系统发育树,裂腹鱼亚科鱼类形成一个支持率较高的单系群,Bootstrap检验支持率为99%,系统进化树聚类方式与以遗传距离值为标准的鉴定结果一致,很好地反映了水系物种间的地理和历史联系.

著录项

  • 来源
    《淡水渔业》 |2019年第1期|33-41|共9页
  • 作者单位

    西藏自治区农牧科学院水产科学研究所;

    拉萨850032;

    河南农业大学牧医工程学院;

    郑州450002;

    西藏自治区农牧科学院水产科学研究所;

    拉萨850032;

    西藏自治区农牧科学院水产科学研究所;

    拉萨850032;

    中国水产科学研究院黑龙江水产研究所;

    哈尔滨150000;

    西藏自治区农牧科学院水产科学研究所;

    拉萨850032;

    西藏自治区农牧科学院水产科学研究所;

    拉萨850032;

    西藏自治区农牧科学院水产科学研究所;

    拉萨850032;

  • 原文格式 PDF
  • 正文语种 chi
  • 中图分类 水产动物学;
  • 关键词

    西藏; 裂腹鱼; DNA条形码; COI; 物种鉴定;

相似文献

  • 中文文献
  • 外文文献
  • 专利
获取原文

客服邮箱:kefu@zhangqiaokeyan.com

京公网安备:11010802029741号 ICP备案号:京ICP备15016152号-6 六维联合信息科技 (北京) 有限公司©版权所有
  • 客服微信

  • 服务号