红树林土壤微生物模块化聚酮合酶基因(簇)及其多样性研究

张翔; 周峻岗; 董俊德; 吕红

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红树林土壤微生物模块化聚酮合酶基因(簇)及其多样性研究

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聚酮类化合物(Polyketide)是一类重要的具有药用价值的生物活性分子.通过宏基因组学技术获得了红树林土壤微生物中模块化聚酮合酶(Polyketide Synthase,PKS)基因(簇),并对其多样性进行了研究.首先构建了该红树林土壤微生物的16SrDNA文库,初步分析了红树林土壤样本的细菌群落组成,发现许多菌群曾经被报道存在PKS基因簇,约占整个细菌群落的75%.利用相关菌群的PKS酮基合成酶结构域(Ketosynthase,KS)的保守区域序列信息设计简并引物,并构建了KS DNA序列文库.经测序获得131条新型KS序列,该结果表明红树林土壤微生物中蕴含了许多新型的聚酮类化合物合成酶.为了进一步获得聚酮合酶基因(簇),我们通过土壤微生物宏基因组Cosmid文库的构建与筛选,得到了13个属于trans-AT PKS,cis-AT PKS,NRPS/PKS Hybrid等类型的聚酮合酶的基因(簇),并通过构建KS序列的系统进化树分析了样本中聚酮合酶的多样性组成.

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来源
《复旦学报：自然科学版》 |2015年第2期|137-147|共11页
作者
张翔; 周峻岗; 董俊德; 吕红;
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作者单位

复旦大学生命科学学院遗传工程国家重点实验室上海市工业菌株工程技术研究中心;

中国科学院南海海洋研究所中国科学院热带海洋生物资源与生态重点实验室;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类微生物学;
关键词
宏基因组; 红树林; 土壤微生物; 聚酮合酶(PKS); 聚酮合酶基因簇; 多样性分析;

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