基于转录组测序筛选和田羊毛囊周期性变化过程中差异表达miRNAs以及初步分析

孙爽; 阿布来提·苏来曼; 李彬; 李志强; 侯晨曦; 决肯·阿尼瓦什; 依明·苏来曼

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基于转录组测序筛选和田羊毛囊周期性变化过程中差异表达miRNAs以及初步分析

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为了探讨miRNAs在和田羊毛囊周期性变化中皮肤组织的表达差异,同时预测其在和田羊毛囊周期性变化过程中发挥的潜在功能.本研究选取和田羊毛囊周期性变化的生长期(P1、5月份、n=3)、退行期(P2、10月份、n=3)以及休止期(P3、次年1月份、n=3)的皮肤毛囊组织为材料进行转录组测序和分析.结果共鉴定了143个已知miRNAs并预测了759个新miRNAs,显示相较于P1组,P2组共鉴定了173个显著差异表达miRNAs,其中包含7个显著上调的miRNAs与166个显著下调的miRNAs;而在P3组中鉴定了243个差异表达miRNAs,其中包含28个显著上调的miRNAs与215个显著下调的miRNAs;相较于P2组,P3组共鉴定了71个显著差异表达miRNAs,其中包含23个显著上调的miRNAs与48个显著下调的miRNAs.针对差异表达miRNAs进行靶基因预测和功能分析,发现靶基因显著富集在与毛囊发育相关的激素水平调节、细胞分解代谢、周期蛋白结合、骨细胞发育等GO条目中以及与毛囊发育相关的AMPK、Hedgehog、TNF等信号通路中.在和田羊毛囊周期性变化过程中差异表达miRNAs可能通过以上通路调控靶基因的表达进而参与和田羊毛囊的周期性变化过程.

著录项

来源
《草食家畜》 |2021年第6期|10-21|共12页
作者
孙爽; 阿布来提·苏来曼; 李彬; 李志强; 侯晨曦; 决肯·阿尼瓦什; 依明·苏来曼;
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作者单位

新疆农业大学动物科学学院乌鲁木齐 830052;

新疆畜牧科学院畜牧研究所乌鲁木齐 830011;

新疆农业大学动物科学学院乌鲁木齐 830052;

新疆农业大学动物科学学院乌鲁木齐 830052;

新疆农业大学动物科学学院乌鲁木齐 830052;

新疆农业大学动物科学学院乌鲁木齐 830052;

新疆农业大学动物科学学院乌鲁木齐 830052;

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正文语种 chi
中图分类猪;
关键词
和田羊; 毛囊周期性变化; 差异表达miRNAs; 靶基因;

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