基于Hi-C技术哺乳动物三维基因组研究进展

宁椿游; 何梦楠; 唐茜子; 朱庆; 李明洲; 李地艳

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基于Hi-C技术哺乳动物三维基因组研究进展

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基因组DNA在细胞核中并不是呈线性的一字排列,而是以三维结构高度折叠并浓缩成染色质的方式储存于核内,具有特定的高级空间结构和构象.高通量染色体构象捕获(high-througnput chromosome conformation capture,Hi-C)技术于2009年首次被提出,目前已得到大规模运用,使得人们对于三维基因组学有了更深刻的认识.研究表明,哺乳动物基因组三维层级结构单元由大到小依次为染色体疆域(chromosome territory,CT)、染色质区室(chromatin compartment A/B)、拓扑关联结构域(topological associated domain,TAD)和染色质环(chromatin loop),这些层级结构单元在基因转录和表达调控过程中发挥着重要作用.本文基于Hi-C技术从染色质的三维层级结构划分、构象单元作用以及三维基因组在发育、疾病等方面的应用进行阐述,旨在为更深入地了解哺乳动物三维基因组学研究提供参考.

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来源
《遗传》 |2019年第3期|215-233|共19页
作者
宁椿游; 何梦楠; 唐茜子; 朱庆; 李明洲; 李地艳;
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作者单位

四川农业大学动物科技学院,动物遗传育种研究所,成都 611130;

四川农业大学动物科技学院,动物遗传育种研究所,成都 611130;

四川农业大学动物科技学院,动物遗传育种研究所,成都 611130;

四川农业大学动物科技学院,动物遗传育种研究所,成都 611130;

四川农业大学动物科技学院,动物遗传育种研究所,成都 611130;

四川农业大学动物科技学院,动物遗传育种研究所,成都 611130;

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正文语种 chi
中图分类
关键词
三维基因组学; 染色质空间构象; Hi-C技术; 基因表达调控;

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