miR-206是前期课题组通过全转录组测序筛选出的高低剩余采食量肉牛(Bos taurus)中差异显著的小RNA(microRNAs,miRNAs)之一,为探究miR-206对牛肌肉生长发育的调节作用,本研究以’秦川牛’miR-206为研究对象,分析了miR-206在各物种间的亲缘关系,通过TargetScan、miRWalk等在线软件预测了牛miR-206潜在靶基因并对靶基因进行GO和KEGG富集分析,通过qPCR方法检测牛各组织中miR-206的表达规律。结果表明,牛miR-206与山羊(Capra hircus)的亲缘关系最近,其次是马(Equus caballus),与爪蟾(Xenopus laevis)的亲缘关系最远;miR-206的潜在靶基因中与肌肉发育相关的有组蛋白去乙酰酶4(histone deacetylase 4,HDAC4)、热休克蛋白家族D成员1(heat shock protein family d member 1,HSPD1)、纤维连接蛋白1(fibronectin,FN1)等;功能富集分析发现,预测的靶基因显著富集于MAPK、PI3K-AKT和TNF等与肌肉发育相关的信号通路。qPCR结果显示,miR-206在成年牛腿肌和背最长肌中的表达量最高且极显著高于其他组织(P<0.01),其次是肝脏,在十二指肠及皮下脂肪中的表达量最低;与初生犊牛相比,成年牛皮下脂肪中miR-206表达量极显著下调(P<0.01),背最长肌和腿肌中表达量极显著上调(P<0.01)。本研究结果将为进一步探究miR-206在牛肌肉生长发育过程中的作用提供参考。
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