山枇杷基因组DNA的提取及自然群体内ISSR遗传多样性分析

赖瑞联; 徐洋; 赖恭梯; 钟春水; 林玉玲; 赖钟雄

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山枇杷基因组DNA的提取及自然群体内ISSR遗传多样性分析

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为探究山枇杷基因组DNA提取方法及群体内个体之间的遗传多样性,以采自福建省戴云山脉九仙山山枇杷（Garcinia multiflora）自然群体的41份叶片样品为材料,比较2种改良十六烷基三甲基溴化铵法（CTAB）对其基因组DNA的提取效果,并通过简单序列重复区间—聚合酶链式反应（ISSR-PCR）扩增反应体系分析其群体内遗传多样性。结果表明,CTAB-2法通过适当提高CTAB浓度,添加聚乙烯吡咯烷酮（PVP）和酚—氯仿—异戊醇,获得的基因组DNA纯度和质量较好;筛选的11条ISSR引物共扩增85个条带,其中多态性条带61条,占71.76%;NTSYS 2.10e软件设定阈值（GS）为0.78,该山枇杷样品归为4个类群,样品遗传相似系数介于0.588-0.929,平均为0.779,说明该群体的遗传基础较宽;利用STRUCTURE 2.2软件将样品分为4个类群,结合后验概率（Q值）分布表表明部分个体之间存在较丰富的遗传信息交流。

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来源
《森林与环境学报》 |2015年第1期|P.53-59|共7页
作者
赖瑞联; 徐洋; 赖恭梯; 钟春水; 林玉玲; 赖钟雄;
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作者单位

福建农林大学园艺植物生物工程研究所,福建福州350002;

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正文语种 CHI
中图分类其他;
关键词
山枇杷; 自然群体; 改良十六烷基三甲基溴化铵法; 简单序列重复区间; 聚类分析;

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