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三株猪2型圆环病毒甘肃分离株的全基因组序列分析

         

摘要

根据GenBank中发表的猪2型圆环病毒(PCV2)全基因组序列,设计合成了2对引物,采用PCR方法对来自甘肃不同猪场的3份病料中的PCV2进行基因的扩增、克隆和测序,得到全基因组长度为1 768 bp的PCV2Ww株(登录号DQ322701)以及全基因组长度为1 767 bp的PCV2 LZ株和TS株(登录号DQ363860和DQ355153).应用DNAstar软件序列分析可得,3个分离株全基因组与国内外参考毒株核苷酸序列同源性在94.8%~99.4%,3个分离株之间的核苷酸序列同源性为96.4%~99.4%;PCV2分离株与PCV1分离株核苷酸序列同源性为69.0%~70.0%;ORF1和ORF2所编码的氨基酸序列与国内外PCV2毒株比较,同源性也很高,分别为99.0%~99.4%和92.7%~98.7%.进化树分析表明,PCV2分离毒株在进化上存在地域上的相关性.

著录项

  • 来源
    《甘肃农业大学学报》 |2007年第3期|1-6|共6页
  • 作者单位

    中国农业科学院兰州兽医研究所;

    家畜疫病病原生物学国家重点实验室;

    农业部畜禽病毒学重点开放实验室;

    甘肃;

    兰州;

    730046;

    甘肃农业大学动物科学技术学院;

    甘肃;

    兰州;

    730070;

    中国农业科学院兰州兽医研究所;

    家畜疫病病原生物学国家重点实验室;

    农业部畜禽病毒学重点开放实验室;

    甘肃;

    兰州;

    730046;

    中国农业科学院兰州兽医研究所;

    家畜疫病病原生物学国家重点实验室;

    农业部畜禽病毒学重点开放实验室;

    甘肃;

    兰州;

    730046;

    中国农业科学院兰州兽医研究所;

    家畜疫病病原生物学国家重点实验室;

    农业部畜禽病毒学重点开放实验室;

    甘肃;

    兰州;

    730046;

    中国农业科学院兰州兽医研究所;

    家畜疫病病原生物学国家重点实验室;

    农业部畜禽病毒学重点开放实验室;

    甘肃;

    兰州;

    730046;

    甘肃农业大学动物科学技术学院;

    甘肃;

    兰州;

    730070;

    中国农业科学院兰州兽医研究所;

    家畜疫病病原生物学国家重点实验室;

    农业部畜禽病毒学重点开放实验室;

    甘肃;

    兰州;

    730046;

  • 原文格式 PDF
  • 正文语种 chi
  • 中图分类 单股DNA病毒;
  • 关键词

    猪2型圆环病毒; 基因组; ORF1; ORF2; 序列分析;

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