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白花泡桐二倍体和同源四倍体抗逆基因差异表达的研究

         
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为揭示泡桐抗逆机制,以8 a生白花泡桐的形成层和韧皮部为试验材料,利用高通量测序技术Illumina研究了二倍体和同源四倍体抗逆相关基因的差异表达变化.测序结果表明,二、四倍体泡桐的Clean reads与泡桐参考基因组序列的比对率分别为91.47％ ～91.79％ 和92.08％ ～92.50％,且测序质量较好.可变剪接预测分析发现,外显子可变剪切数量最多,且四倍体泡桐中的可变剪切异构体多于二倍体.抗逆性相关基因的筛选研究结果中共鉴定到3138个与抗逆性相关的差异基因(1929个上调,1209个下调),并对其进行GO功能和KEGG代谢通路分析.采用qRT-PCR技术对随机8个差异基因进行检测,结果显示趋势均与测序结果一致.为了进一步研究抗逆相关基因的功能,对泡桐和其他11个物种的多酚氧化酶(PPO)基因序列进行了进化树分析,结果表明,泡桐与其他物种的PPO基因差异较大,表明泡桐可能是通过PPO基因倍增和丢失的差异变化来响应逆境胁迫.

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