舌鳞癌中高醛脱氢酶活性细胞相关基因的生物信息学分析

孙守娟; 季平; 邹波; 邓诚

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舌鳞癌中高醛脱氢酶活性细胞相关基因的生物信息学分析

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目的:构建舌鳞癌Tca8113细胞中高醛脱氢酶活性(high aldehyde dehydrogenase activity,ALDHhigh)细胞特异性表达基因cDNA文库并进行相应的生物信息学分析.方法:应用抑制性消减杂交(SSH)技术,以ALDHhigh细胞RNA为测试方、低醛脱氢酶活性(ALDHlow)细胞RNA为驱动方,构建文库；应用BLAST、Gene Set Analysis Toolkit V2等软件进行生物信息学分析.结果:随机挑选20个集落进行PCR分析,克隆片段均匀分布在200 bp～ 700 bp,无假阳性克隆,成功构建文库；对120个克隆测序并进行BLAST分析,得到27个差异表达基因；功能聚类发现部分与细胞增殖、生长繁殖、再生等生物行为相关.结论:成功构建的ALDHhigh细胞特异性表达基因cDNA文库,为下一步找出ALDHhigh干细胞特性相关基因提供帮助.

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来源
《实用口腔医学杂志》 |2013年第3期|375-379|共5页
作者
孙守娟; 季平; 邹波; 邓诚;
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作者单位

401147,重庆医科大学附属口腔医院颌面外科;

401147,重庆医科大学附属口腔医院颌面外科;

401147,重庆医科大学附属口腔医院颌面外科;

401147,重庆医科大学附属口腔医院颌面外科;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类口腔、颌面部肿瘤;
关键词
人舌鳞癌Tca8113; 抑制性消减杂交技术; 肿瘤干细胞; 醛脱氢酶; 生物信息学;

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