利用转录组数据鉴定青海钩虾细胞色素P450家族成员

郑志琴; 陈棋昌; 刘丹; 章昭; 晁燕; 祁得林

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淡水钩虾是重要的环境指示生物,尤其是细胞色素P450家族成员的表达可作为早期预警的生物标记。为了鉴定青海钩虾细胞色素P450家族成员,采用Illumina Hiseq^TM2500高通量测序技术对青海钩虾转录组进行测序,并对P450家族成员进行分析鉴定。结果表明:青海钩虾中共获得了273507个转录本,总长为167791835 bp,隶属于233462个unigene,大小为137818327 bp。从转录本中鉴定到青海钩虾14个细胞色素P450家族成员,大部分基因均获得了全长序列60%以上的片段。

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来源
《青海大学学报（自然科学版）》 |2020年第2期|26-32|共7页
作者
郑志琴; 陈棋昌; 刘丹; 章昭; 晁燕; 祁得林;
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作者单位

省部共建三江源生态与高原农牧业国家重点实验室青海大学青海西宁 810016;

青海大学农牧学院青海西宁 810016;

青海大学生态环境工程学院青海西宁 8100161;

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正文语种 chi
中图分类 Q953.1;
关键词
高通量测序; 青海钩虾; 转录组; 细胞色素P450;

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