多发性硬化症和帕金森病共有差异基因的生物信息学分析

王馨雅; 王华峰; 边煜青; 杨鲁红

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多发性硬化症和帕金森病共有差异基因的生物信息学分析

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cqvip:目的运用生物信息学的方法筛选多发性硬化症和帕金森病的相关基因及其作用的分子机制,为自身免疫性疾病的分子发病机制提供有益的探索和依据。方法从美国国立生物技术信息中心(NCBI)的共享数据库GEO(Gene Expression Omnibus)下载多发性硬化症(multiple sclerosis,MS)的基因芯片数据GSE83670和帕金森病(Parkinson’ s disease,PD)的基因芯片数据GSE22491,借助R软件和GEO2R筛选差异表达基因,通过DAVID在线分析网站和Cytoscape软件对差异基因进行生物学功能富集分析和信号通路分析,筛选两类疾病中正常人和患者的差异基因,找出共有的关键基因。结果通过分析,分别从GSE83670和GSE22491中筛选出737个和1 081个差异表达基因,其中共有的差异基因有36个,这些基因主要富集于细胞膜,参与介导免疫应答等生物学过程,并在与免疫调节相关的补体和凝血级联信号通路富集。筛选出 C1QB,PROS1和C1QC 3个与多发性硬化症和帕金森病相关的共有关键基因。结论多发性硬化症和帕金森病的发病机制可能是通过补体与凝血级联反应信号通路实现的,该信号通路上的差异基因可能有望成为自身免疫性疾病的潜在治疗靶点。

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来源
《山西医科大学学报》 |2019年第9期|1278-1282|共5页
作者
王馨雅; 王华峰; 边煜青; 杨鲁红;
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作者单位

山西师范大学生命科学学院遗传学教研室临汾 041004;

阿拉巴马大学伯明翰分校医学院神经系;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类生物信息、生物控制;
关键词
多发性硬化症; 帕金森病; 补体和凝血级联信号通路; 生物信息学;

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