KIAA0101调控胃癌细胞周期的相关基因筛选

王直; 党诚学; 闫融; 张昊; 袁达伟; 李康

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KIAA0101调控胃癌细胞周期的相关基因筛选

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目的筛选KIAA0101基因对细胞周期影响的相关基因.方法以RT-PCR方法分析胃癌组织相对于配对癌旁组织中KIAA0101基因表达量,利用DAVID数据库对差异基因进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析,使用KEGG绘制通路图,将与KIAA0101表达模式相关的基因列表回带入TCGA cBioPortal进行基因之间相互网络作用的关系研究,并借由系统生成基因拓扑关系图.最后采用RT-PCR方法对候选基因进行筛选.结果癌组织中KIAA0101 mRNA表达水平为1.104±0.379,显著高于配对癌旁组织(0.421±0.172;P=0.0179).系统通过汇总分析全部基因探针的表达强度,对来自478例组织中与KIAA0101相关的基因进行了筛选.GO功能分析显示差异基因主要富集在蛋白磷酸化、RNA加工、细胞周期、DNA代谢过程、蛋白质转运、乙酰化、细胞凋亡、蛋白质水解、氧化还原等功能.KIAA0101表达水平的改变主要影响的胃癌相关通路有:细胞周期、剪接体、DNA复制、p53信号转导通路等.KEGG通路图及基因拓扑图显示,BUB1B、MAD2L1、CDC45、CDK1、CCNE1、CCNB2等与KIAA0101相关的基因也与细胞周期相关,RT-PCR结果证实BUB1B、MAD2L、CDK1、CCNE1、CCNB2 mRNA表达水平显著高于配对癌旁组织(P0.05).结论 KIAA0101可能通过影响BUB1B、MAD2L1、CDK1、CCNE1、CCNB2表达产生对细胞周期的影响,这个结果可以为KIAA0101影响细胞周期的作用机制、肿瘤标志物的筛选和药物靶点的选择提供参考.

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来源
《南方医科大学学报》 |2018年第10期|1151-1158|共8页
作者
王直; 党诚学; 闫融; 张昊; 袁达伟; 李康;
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作者单位

西安交通大学医学院第一附属医院;

陕西西安 710061;

陕西省结核病防治院;

陕西西安 710100;

西安交通大学医学院第一附属医院;

陕西西安 710061;

西安交通大学医学院第一附属医院;

陕西西安 710061;

西安交通大学医学院第一附属医院;

陕西西安 710061;

西安交通大学医学院第一附属医院;

陕西西安 710061;

西安交通大学医学院第一附属医院;

陕西西安 710061;

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正文语种 chi
中图分类
关键词
KIAA0101; 生物信息学; 细胞周期; 基因; 胃癌;

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