基于生物信息学方法筛选散发性克雅氏病神经炎症相关关键基因

程雅静; 刘莹; 王菲

首页> 中文期刊> 《天津医科大学学报》 >基于生物信息学方法筛选散发性克雅氏病神经炎症相关关键基因

基于生物信息学方法筛选散发性克雅氏病神经炎症相关关键基因

开具论文收录证明 >>

期刊封面封底目录下载 >>

文献代查 >>

页面导航

摘要
著录项
相似文献
相关主题

摘要

目的:鉴定散发性克雅氏病(SCJD)神经炎症相关的关键基因。方法:用GEO2R工具筛选GSE160208数据集中的SCJD脑组织(n=27)和正常脑组织(n=20)的差异表达基因(DEGs)。用R语言的“cluster Profiler”和“DOSE”包对DEGs进行富集分析。通过STRING数据库和Cytoscape软件构建蛋白质相互作用(PPI)网络并筛选关键基因。用GSE124571数据集验证关键基因的表达,绘制关键基因的受试者工作特征(ROC)曲线鉴定hub genes。结果:本研究有127个DEGs,富集分析结果提示DEGs与吞噬体、核因子-κB信号通路和B细胞受体信号通路等有关。经过PPI网络的构建、hub基因RNA表达的验证和ROC曲线的绘制,最终TLR2、C1QA、ITGAM、C3AR1在SCJD中表达升高(t=2.12、3.197、3.107、3.284,均P0.9),被筛选为SCJD hub基因。结论:TLR2、C1QA、ITGAM、C3AR1在SCJD中有关键作用,可以作为SCJD发展过程中神经炎症相关的hub基因。

著录项

来源
《天津医科大学学报》 |2022年第1期|1-7|共7页
作者
程雅静; 刘莹; 王菲;
展开▼
作者单位

天津医科大学总医院神经内科;

天津300052;

展开▼
原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类 R742.89;
关键词
散发性克雅氏病; 神经炎症; 生物信息学; 关键基因;

相似文献

中文文献
外文文献
专利

1. 基于生物信息学方法筛选乙型肝炎病毒相关肝癌的关键基因和临床预后 [J] . 李玉杰 ,杨雪佳 ,吴登强 . 海南医学 . 2020,第024期
2. 基于生物信息学方法筛选与肝细胞癌发生和预后相关的潜在关键基因 [J] . 石华盛 ,辛洋 ,韩冰 . 精准医学杂志 . 2020,第004期
3. 基于生物信息学方法筛选与肝细胞癌发生和预后相关的潜在关键基因 [J] . 石华盛 ,辛洋 ,韩冰 . 精准医学杂志 . 2020,第004期
4. 基于基因芯片公共数据库及生物信息学方法筛选类风湿关节炎滑膜组织关键基因及通路 [J] . 史晋宇 ,乔军 ,胡方媛 . 中华风湿病学杂志 . 2020,第011期
5. 女性糖尿病周围神经病变相关基因筛选及生物信息学分析 [J] . 张艺 ,邱珍 ,夏中元 . 海南医学院学报 . 2020,第001期
6. 基于生物信息学筛选KRAS突变型结直肠癌关键基因及信号通路 [C] . 张海燕 ,王捷 ,张伟 . 中国生物工程学会第十二届学术年会暨2018年全国生物技术大会 . 2018
7. 基于生物信息学方法筛选骨关节炎相关关键分子靶点 [A] . 李升扬 . 2021

基于生物信息学方法筛选散发性克雅氏病神经炎症相关关键基因

摘要

著录项

相似文献

相关主题

期刊订阅