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【2h】

Protocol for hit-to-lead optimization of compounds by auto in silico ligand directing evolution (AILDE) approach

机译：硅配体引导演进（AIDDE）方法在硅配体中的复合优化方案的命运优化方案

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摘要

Hit-to-lead (H2L) optimization is crucial for drug design, which has become an increasing concern in medicinal chemistry. A virtual screening strategy of auto in silico ligand directing evolution (AILDE) has been developed to yield promising lead compounds rapidly and efficiently. The protocol includes instructions for fragment compound library construction, conformational sampling by molecular dynamics simulation, ligand modification by fragment growing, as well as the binding free energy prediction.
机译：命中铅（H2L）优化对于药物设计至关重要，这已成为药用化学的越来越关注。已经开发了一种在硅配体引导演化（Ailde）中的自动的虚拟筛选策略，以快速有效地产生有前途的铅化合物。该方案包括片段复合文库构建的指令，通过分子动力学模拟的构象采样，通过片段生长的配体改性，以及结合的自由能预测。

著录项

  • 期刊名称 STAR Protocols
  • 作者

    Longcan Mei; Fengxu Wu; Gefei Hao; Guangfu Yang;

  • 作者单位
  • 年(卷),期 2021(2),1
  • 年度 2021
  • 页码 100312
  • 总页数 13
  • 原文格式 PDF
  • 正文语种
  • 中图分类
  • 关键词

    机译：生物信息学;蛋白质生物化学;结构生物学;

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