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首页> 外文期刊>Pharmacogenetics and genomics >Polymorphisms predicted to alter function in prostaglandin E2 synthase and prostaglandin E2 receptors.
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Polymorphisms predicted to alter function in prostaglandin E2 synthase and prostaglandin E2 receptors.

机译：多态性预计会改变前列腺素E2合酶和前列腺素E2受体的功能。

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BACKGROUND AND OBJECTIVE: Prostaglandin synthesis is the primary target of aspirin and other nonsteroidal antiinflammatory drugs, and thus is a pathway of major interest to pharmacology, pharmacogenetics, and epidemiology. Several lines of evidence implicate prostaglandin E2 in carcinogenesis; this study aimed to identify genetic variants in genes related to prostaglandin E2 synthesis and signaling. METHODS: We resequenced the coding regions of human prostaglandin E2 synthase (PGES), and prostaglandin E2 receptors EP1, EP2, and EP4 in 48 African-Americans and 47 Caucasians. RESULTS AND CONCLUSIONS: We identified 23 variants, 6 of which cause amino acid changes. The non-synonymous polymorphisms in PGES, EP1, and EP2 were present only among African-Americans; both populations carried non-synonymous polymorphisms in EP4. We used two sequence homology-based programs, SIFT and PolyPhen, to predict the impact of these polymorphisms. These programs predicted that the amino-acid changes p.Phe119Val in EP1, p.Ala44Glu in EP2, and possibly p.Val7Glu in PGES, p.Thr176Ile in EP4 and p.Gly420Asp in EP4 are likely to affect protein function. Thus, these variants may be relevant for inflammatory conditions, carcinogenesis, and pharmacogenetics.
机译：背景与目的：前列腺素的合成是阿司匹林和其他非甾体类抗炎药的主要靶点，因此是药理学，药物遗传学和流行病学研究的主要途径。有多种证据表明前列腺素E2参与了癌变。这项研究旨在鉴定与前列腺素E2合成和信号传导有关的基因中的遗传变异。方法：我们对48位非洲裔美国人和47位白种人中人前列腺素E2合酶（PGES）和前列腺素E2受体EP1，EP2和EP4的编码区进行了重新测序。结果与结论：我们鉴定了23个变异体，其中6个会引起氨基酸变化。 PGES，EP1和EP2中的非同义多态性仅存在于非裔美国人中。两个种群均在EP4中携带非同义多态性。我们使用了两个基于序列同源性的程序，SIFT和PolyPhen，来预测这些多态性的影响。这些程序预测，EP1中的p.Phe119Val，EP2中的p.Ala44Glu，以及PGES中的p.Val7Glu，EP4中的p.Thr176Ile和EP4中的p.Gly420Asp的氨基酸变化都可能影响蛋白质功能。因此，这些变体可能与炎性疾病，致癌作用和药物遗传学有关。

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