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Building and exploring an integrated human kinase network: Global organization and medical entry points

机译：建立和探索整合的人类激酶网络：全球组织和医疗切入点

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Biological matter is organized in functional networks of different natures among which kinase-substrate and protein-protein interactions play an important role. Large public data collections allowed us to compile an important corpus of interaction data around human protein kinases. One of the most interesting observations analyzing this network is that coherence in kinase functional activity relies on kinase substrate interactions primarily and not on which protein complexes are formed around them. Further dissecting the two types of interactions at the level of kinase groups (CMGCs, Tyrosine kinases, etc.) we show a prevalence of intra-group interconnectivity, which we can naturally relate to current scenarios of evolution of biological networks. Tracking publication dates we observe high correlation of kinase interaction research focus with general kinase research. We find a similar bias in the targets of kinase inhibitors that feature high redundancy. Finally, intersecting kinase inhibitor specificity with sets of kinases located at specific positions in the kinase network, we propose alternative options for future therapeutic strategies using these compounds.
机译：生物物质以不同性质的功能网络组织，其中激酶-底物和蛋白质-蛋白质相互作用起重要作用。大量的公共数据收集使我们能够围绕人类蛋白激酶汇编重要的相互作用数据语料库。分析该网络最有趣的发现之一是，激酶功能活性的一致性主要取决于激酶底物的相互作用，而不依赖于它们周围形成的蛋白质复合物。在激酶组水平上进一步剖析两种类型的相互作用（CMGC，酪氨酸激酶等），我们显示了组内互连的普遍性，我们可以自然地将其与生物网络进化的当前情况联系起来。跟踪发布日期，我们观察到激酶相互作用研究重点与常规激酶研究高度相关。我们在具有高冗余度的激酶抑制剂的靶标中发现了类似的偏倚。最后，将激酶抑制剂的特异性与位于激酶网络中特定位置的激酶组相交，我们为使用这些化合物的未来治疗策略提出了备选方案。

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